Os modelos físicos podem ser difíceis de criar, especialmente para sistemas complexos. Eles também podem ser caros e demorados para construir e manter. Os modelos físicos também podem não ser capazes de representar com precisão todos os aspectos de um sistema, pois alguns elementos podem ser muito pequenos ou complexos para serem modelados com precisão. Além disso, os modelos físicos podem ser difíceis de alterar ou atualizar, pois muitas vezes são fixos e não podem ser facilmente modificados. Isso pode dificultar o acompanhamento das mudanças no sistema que está sendo modelado. Além disso, os modelos físicos podem ser difíceis de transportar e armazenar, pois podem ser volumosos e pesados.