p O protocolo começa com o tratamento do Vortex Fluidic Device (VFD) de uma mistura de proteinase K e o congelado, em seguida, tecido quebrado. A mistura de reação é em seguida processada para remover sólidos e inibidores da DNA polimerase. O DNA recuperado é então purificado e concentrado. Finalmente, o DNA é amplificado, quantificado, e caracterizado por (B) qPCR e (C) sequenciamento de DNA das amostras. Crédito:PLOS ONE
p O DNA em espécimes de museu preservados pode permitir que os cientistas explorem a história das espécies e o impacto das humanidades no ecossistema, mas as amostras são normalmente preservadas em formaldeído, que pode danificar o DNA e tornar muito difícil sua recuperação. p Os pesquisadores usaram um dispositivo fluídico de vórtice (VFD) para acelerar a extração de DNA de uma lagosta americana preservada em formaldeído - com os resultados fornecendo um roteiro para explorar o DNA de milhões de espécies valiosas e até extintas em museus em todo o mundo.
p A candidata do Flinders PHD, Jessica Phillips, diz que o processamento do tecido preservado de espécimes de museu no VFD quebra as proteínas, liberando DNA que oferece informações genéticas históricas importantes.
p "A extração de DNA é obtida pelo processamento do tecido preservado em uma solução de enzima no VFD. Essa enzima quebra as proteínas, liberando o DNA que pode ser analisado. Ao usar o VFD, podemos acelerar esse processo de dias para horas, "diz a Sra. Phillips.
p “Por 150 anos essas amostras foram preservadas em formaldeído que pode danificar o DNA e também dificultar a recuperação do DNA. Usamos energia mecânica em um dispositivo de vórtice fluídico (VFD) para acelerar a extração, processando o tecido preservado em uma solução enzimática em o VFD. "
p Este trabalho é uma colaboração entre a Universidade da Califórnia, Irvine (UCI), O Departamento de Biologia Organísmica e Evolutiva da Universidade de Harvard, e a Flinders University.
p Jessica Phillips com Vortex Fluidic Device na Flinders University. Crédito:Flinders University
p Os pesquisadores dizem que os resultados fornecem um roteiro para explorar o DNA de milhões de espécies históricas e até mesmo extintas em museus em todo o mundo.
p O presidente de pesquisa da Clean Technology Research Professor Colin Raston diz que o trabalho se baseia no corpo de cerca de 80 artigos que seu grupo de pesquisa publicou sobre o dispositivo fluídico de vórtice.
p "As aplicações do VFD estão se expandindo rapidamente, mas isso foi possivelmente apenas por colaboração interna. O aplicativo de extração de DNA envolveu a colaboração com dois outros laboratórios de pesquisa liderados pelo professor Greg Weiss na UCI e o professor Peter Girguis em Harvard. "
p "Nós apenas arranhamos a superfície sobre o que é possível para este dispositivo, "diz o professor Raston."
