É difícil deixar as pessoas entusiasmadas com software, diz Eliza Grames, doutorando em ecologia e biologia evolutiva. Ainda, o software que ela desenvolveu é empolgante para qualquer pessoa prestes a embarcar em uma nova pesquisa e tentar determinar se é realmente ... novo.

Coloque-se na pele de um pesquisador.

Antes de qualquer novo estudo, uma revisão completa e exaustiva da literatura existente deve ser feita para garantir que o projeto seja novo. Ou, para determinar se há dados existentes que podem ser usados ​​para responder à sua nova pergunta.

Esta é uma tarefa difícil, especialmente considerando que milhões de novos artigos de pesquisa são publicados a cada ano. Onde alguém começa a explorar todos esses dados?

"Cada novo estudo contribui mais para o que sabemos sobre um tópico, adicionando nuances e complexidade que ajuda a melhorar nossa compreensão do mundo natural. Para dar sentido a essa riqueza de evidências e chegar mais perto de uma imagem completa do mundo, pesquisadores estão cada vez mais se voltando para métodos de revisão sistemática como uma forma de sintetizar essas informações, "diz Grames.

Revisões sistemáticas iniciadas nos campos da medicina e saúde pública, onde manter-se atualizado com a pesquisa pode ser, literalmente, uma questão de vida ou morte, diz Grames. (Você já se perguntou como seu médico sabe sobre os tratamentos mais recentes para sua condição?)

"Nesses campos, existe um sistema estabelecido com cabeçalhos de assuntos médicos, onde os artigos são marcados com palavras-chave associadas ao trabalho, mas a ecologia não tem isso. "

Outros campos de pesquisa em todo o espectro científico estavam no mesmo barco.

O projeto surgiu por necessidade. Em seu próprio processo de revisão, Grames observou que sentiria falta de artigos e termos-chave e estava interessada em descobrir como identificar esses termos ausentes. Então, Grames decidiu criar um sistema que os pesquisadores da área de ecologia, ambiente, biologia de conservação, biologia evolutiva e outras ciências, poderia usar.

"Enquanto estávamos trabalhando neste software, percebemos que havia uma maneira muito mais rápida de fazer as avaliações do que os outros, "diz Grames, "A maneira tradicional consistia principalmente em examinar os papéis, retirar um termo e depois ler o resto do artigo para identificar mais termos a serem usados."

Mesmo com palavras-chave bastante específicas, Grames observa que a revisão sistemática média em seu campo de biologia da conservação inicialmente rende cerca de 10, 000 artigos de pesquisa. Embora seja importante recuperar informações relevantes, muitas informações irrelevantes podem adicionar tempo desnecessário.

"Cada ano, a quantidade de dados continua aumentando. Existem algumas revisões sistemáticas que se você olhar para a quantidade de tempo que levaria apenas três anos atrás, levariam cerca de 300 dias para serem executados. Se as mesmas revisões fossem feitas hoje, levariam cerca de 350 dias porque o número de publicações continua aumentando. "

Grames diz que levou cerca de um mês ou mais para discutir ideias para o software, então ela passou um verão escrevendo e corrigindo o código. O resultado é um pacote de software de código aberto chamado litsearchr.

Como funciona, diz Grames, é que um usuário fará uma pesquisa em alguns bancos de dados.

"As palavras-chave devem ser bastante relevantes inseridas no algoritmo para extrair todas as palavras-chave potenciais, que são então colocados em uma rede. As palavras-chave originais estão no centro da rede e são as mais bem conectadas. "

Grames diz que o tempo necessário para desenvolver uma estratégia de busca foi reduzido em 90%.

Apresentado com os artigos mais relevantes, os pesquisadores então têm significativamente menos papéis para analisar manualmente. Esta fase de revisão está parcialmente automatizada agora, também, adiciona Grames.

Litsearchr é parte de um esforço colaborativo de pesquisadores, chamado metaverso, onde o objetivo é vincular vários pacotes de software entre si para que os pesquisadores possam realizar suas pesquisas do início ao fim na mesma linguagem de codificação.

"Os pesquisadores podem desenvolver suas revisões sistemáticas, importar dados, e há até mesmo um pacote que pode escrever a seção de resultados para a revisão sistemática, "diz Grames.

Grames e sua equipe configuraram o software para que pudesse ser usado por qualquer pessoa, se eles podem codificar ou não, usando modelos prontos. Há também um vídeo detalhado passo a passo para guiar os usuários pelo processo.

Ao manter o software de código aberto, Grames diz que a depuração e a edição foram aprimoradas porque os usuários podem apontar detalhes que precisam de atenção. "Sempre que recebo um e-mail, é tão emocionante. É bom tê-lo aberto porque as pessoas podem me avisar quando houver um erro de digitação. "

O software está sendo usado por pesquisadores em ciência nutricional e psicologia, e para um grande esforço de triagem de todos os papéis pertencentes a populações de insetos em todo o mundo.

"Não poderíamos fazer este projeto sem o nível de automação que obtemos com o litsearchr. Construí isso a partir da necessidade de outro projeto, mas este software está tornando possível fazer análises ainda maiores do que antes. "