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  • Nova ferramenta aborda a crise de reprodutibilidade na ciência

    Pesquisadores do Instituto de Engenharia Molecular e do Laboratório Nacional de Argonne desenvolveram uma plataforma para fornecer dados pesquisáveis ​​de publicações de cientistas a fim de abordar a questão da reprodutibilidade. Crédito:shutterstock.com

    A comunidade científica tem lutado com o problema da reprodutibilidade dos dados - uma etapa fundamental no processo que orienta como a maioria dos cientistas cria conhecimento em seu campo.

    De acordo com uma pesquisa recente, mais de 70 por cento dos pesquisadores tentaram e não conseguiram reproduzir os experimentos publicados de outro cientista. Mais da metade nem mesmo conseguiu reproduzir suas próprias investigações com sucesso. Isso levanta a questão:se um experimento ou simulação não pode ser reproduzido, foi bem-sucedido em primeiro lugar?

    Pesquisadores do Instituto de Engenharia Molecular da Universidade de Chicago e do Laboratório Nacional de Argonne pretendem ajudar a resolver esse problema com uma nova plataforma de software que permite aos cientistas compartilhar os dados de cada uma de suas publicações de forma pesquisável. Nos últimos dois anos, eles desenvolveram uma ferramenta de curadoria, descobrir e explorar artigos científicos reproduzíveis chamados Qresp, que agora está disponível para uso público.

    “Nosso objetivo é agilizar o processo científico e reduzir o tempo necessário para compartilhar o conhecimento entre os pesquisadores, "disse Giulia Galli, o Professor de Engenharia Molecular da Família Liew. "Ao tornar os dados disponíveis e pesquisáveis, esperamos tornar mais fácil para os pesquisadores reproduzir os resultados. "

    O processo de reprodução dos resultados científicos continua sendo uma questão complexa. Artigos publicados, que estão disponíveis online como PDFs, muitas vezes não incluem informações suficientes sobre os dados e processos resultantes para que outros reproduzam os resultados, e os dados muitas vezes não são disponibilizados para a comunidade científica.

    “Muitos artigos não incluem detalhes suficientes para reproduzir os dados, "disse Marco Govoni, cientista assistente em Argonne e cientista visitante na Universidade de Chicago. "E, muitas vezes, a maioria dos dados obtidos e usados ​​no papel não está disponível. Para obter esses dados, às vezes você precisa escrever para os autores do artigo. Não deveria ser tão difícil, e não deve ser um processo ad hoc. "

    Com Qresp, os pesquisadores esperam ajudar a aliviar algumas das dificuldades atuais em tornar os dados abertos e reproduzíveis. O software orienta os usuários através do processo de organização e compartilhamento de seus dados, incluindo conjuntos de dados e gráficos. Todos os campos são personalizáveis, permitindo que os pesquisadores organizem seus dados da melhor maneira, de acordo com o artigo que escreveram. A plataforma também está disponível para quem deseja explorar dados compartilhados por outros pesquisadores.

    Embora tenha havido vários esforços para gerenciar grandes conjuntos de dados, a maioria desses esforços depende de um repositório central, enquanto Qresp depende de um modelo distribuído. Na plataforma, os pesquisadores não carregam dados, mas hospedam seus próprios dados selecionados e decidem o que desejam compartilhar. Dessa maneira, Qresp fornece uma solução escalonável para compartilhar dados, Disse Govoni.

    Os pesquisadores que podem não querer dar esse passo extra para compartilhar seus dados logo após a publicação devem considerar os benefícios de organizar e compartilhar dados para seu próprio grupo, Galli disse. Os alunos em seu grupo agora selecionam automaticamente seus dados no Qresp como mais uma etapa em sua pesquisa científica. Qresp facilita a transferência de informação e conhecimento entre projetos realizados por diferentes alunos, e entre os pesquisadores que ficam e os que saem do grupo.

    "Todo o processo de compartilhamento de dados no grupo se tornou muito mais eficiente, "disse Galli, que também é professor de química e cientista sênior na Argonne.

    Com o uso e adoção de Qresp por uma ampla comunidade de pesquisadores, artigos publicados podem se tornar muito mais interativos - uma interface viva onde, clicando em uma imagem, um pesquisador pode ver o conjunto de dados por trás dos resultados.

    “Queremos elevar o padrão de reprodução de resultados científicos, e queremos ir além da publicação de PDFs e compartilhar pesquisas que são muito mais interativas e úteis, "Disse Govoni.


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