O pKa do ácido fluoroacético é 2,66 .

Este valor indica que o ácido fluoroacético é um ácido mais forte do que o ácido acético (pKa =4,76). A presença do átomo de flúor altamente eletronegativo afasta a densidade eletrônica do grupo carboxila, fazendo com que o íon hidrogênio seja liberado mais facilmente e, assim, aumentando a acidez.