As dobras de oligoureia imitam peptídeos alfa-hélices e se ligam efetivamente a alvos de drogas
p Crédito:Wiley
p Algumas drogas úteis consistem em peptídeos agindo em seus alvos proteicos. Para torná-los mais eficientes e estáveis, os cientistas descobriram uma maneira de substituir segmentos cruciais dos peptídeos por unidades de ureido. Esses oligoureas, que são compostos de unidades à base de ureia, dobrar em uma estrutura semelhante à dos peptídeos. Peptídeos "falsos" baseados em oligoureia aumentam as opções para o design racional de medicamentos, conclui estudo publicado na revista
Angewandte Chemie . p Vários medicamentos são peptídeos que inibem ou ativam as ações de certas proteínas. Para aumentar sua eficiência, os cientistas estão investigando imitações de peptídeos. Os mimetizadores de peptídeos contêm filamentos de pequenas unidades orgânicas que se assemelham a aminoácidos - os blocos de construção dos peptídeos - mas não são idênticos a eles. O raciocínio é que as enzimas proteolíticas irão menos provavelmente atacar essas fitas de peptídeos falsos, então as drogas seriam mais eficazes.
p Contudo, as fitas sintéticas - chamadas de oligômeros - devem se dobrar na estrutura do peptídeo original para se ligar a sua proteína-alvo de maneira adequada. Gilles Guichard e sua equipe do CNRS, Universidade de Bordéus, e colegas da Universidade de Estrasburgo e Ureka Pharma, Mulhouse, França, exploraram oligômeros feitos de unidades de ureido, que são derivados da ureia. Esses oligoureias se dobram em uma hélice, uma das estruturas características dos peptídeos. Contudo, existem pequenas diferenças. "As hélices de oligoureia têm menos resíduos por volta, um aumento menor por turno, e um diâmetro maior do que o peptídeo alfa-hélice original, "diz Guichard.
p Para determinar se oligoureias podem imitar estruturas reais de peptídeos, os pesquisadores prepararam híbridos de peptídeo-oligoureia e investigaram sua ligação às proteínas-alvo. Um dos alvos, MDM2, é um regulador natural da proteína supressora de tumor p53. O outro, VDR, é uma proteína necessária na regulação do crescimento celular, imunidade, e outras funções biológicas.
p Para o mimetizador de peptídeo de ligação a MDM2, os pesquisadores prepararam híbridos substituindo três aminoácidos-chave terminais por unidades de ureido. Para o mimetizador de peptídeo de ligação a VDR, eles substituíram o segmento de aminoácidos do meio por unidades de ureido. Após algumas rodadas de otimização, os autores encontraram estruturas híbridas com altas afinidades de ligação.
p As afinidades de ligação foram semelhantes às dos péptidos originais. Além disso, A análise de raios-X revelou que as estruturas híbridas adotaram uma estrutura helicoidal regular. Contudo, as hélices ainda eram um pouco mais largas e tinham espaços maiores entre as cadeias laterais ao longo da espinha dorsal da oligoureia do que os dos peptídeos naturais.
p Espera-se que os híbridos de peptídeo-oligoureia resistam à degradação proteolítica, um objetivo importante na química medicinal. Outra vantagem é que permitem mais modificações. "Alfa aminoácidos podem ser substituídos em duas posições, mas as unidades ureido têm mais um site, "diz Guichard. Isso significa que as drogas híbridas de peptídeo-oligoureia oferecem mais opções de otimização.