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A espectrometria de massa em tandem é uma ferramenta analítica poderosa usada para caracterizar misturas complexas na descoberta de drogas e em outros campos.
Agora, Os inovadores da Purdue University criaram um novo método de aplicação de conceitos de aprendizado de máquina ao processo de espectrometria de massa em tandem para melhorar o fluxo de informações no desenvolvimento de novos medicamentos. Seu trabalho é publicado em Ciência Química .
"A espectrometria de massa desempenha um papel fundamental na descoberta e desenvolvimento de drogas, "disse Gaurav Chopra, professor assistente de química analítica e física no Purdue's College of Science. "A implementação específica do aprendizado de máquina bootstrapped com uma pequena quantidade de dados de treinamento positivos e negativos apresentados aqui abrirá o caminho para se tornar o mainstream nas atividades do dia-a-dia de caracterização automatizada de compostos por químicos."
Chopra disse que há dois problemas principais no campo do aprendizado de máquina usado para ciências químicas. Os métodos usados não fornecem compreensão química das decisões que são feitas pelo algoritmo, e novos métodos não são normalmente usados para fazer testes experimentais cegos para ver se os modelos propostos são precisos para uso em um laboratório químico.
"Abordamos esses dois itens para uma metodologia que é seletiva de isômeros e extremamente útil em ciências químicas para caracterizar misturas complexas, identificar reações químicas e metabólitos de drogas, e em campos como proteômica e metabolômica, "Chopra disse.
Os pesquisadores do Purdue criaram modelos de aprendizado de máquina estatisticamente robustos para trabalhar com menos dados de treinamento - uma técnica que será útil para a descoberta de medicamentos. O modelo analisa um reagente neutro comum - chamado 2-metoxipropeno (MOP) - e prevê como os compostos irão interagir com o MOP em um espectrômetro de massa em tandem, a fim de obter informações estruturais para os compostos.
"Esta é a primeira vez que o aprendizado de máquina foi acoplado a reações de íon-molécula de fase gasosa de diagnóstico, e é uma combinação muito poderosa, liderando o caminho para a identificação por espectrometria de massa totalmente automatizada de compostos orgânicos, "disse Hilkka Kenttämaa, o ilustre professor de química analítica e química orgânica de Frank Brown. "Estamos agora introduzindo muitos novos reagentes neste método."
A equipe Purdue apresenta fluxogramas de reatividade química para facilitar a interpretação química das decisões tomadas pelo método de aprendizado de máquina que será útil para entender e interpretar os espectros de massa para informações estruturais.