p Uma equipe de pesquisa liderada por cientistas da Universidade de Nagoya no Japão desenvolveu uma abordagem que pode encontrar rapidamente proteínas sintéticas que se ligam especificamente a alvos importantes, como componentes do vírus SARS-CoV-2. O método foi publicado na revista Avanços da Ciência e pode ser usado para desenvolver kits de teste ou para encontrar tratamentos. p "Desenvolvemos uma técnica de laboratório para seleção rápida de proteínas sintéticas que se ligam fortemente ao SARS-CoV-2, "diz o engenheiro biomolecular da Universidade de Nagoya, Hiroshi Murakami." Proteínas sintéticas de alta afinidade podem ser usadas para desenvolver testes de antígenos sensíveis para SARS-CoV-2 e para uso futuro como anticorpos de neutralização em pacientes infectados. "

p Murakami e seus colegas já haviam desenvolvido um teste de laboratório de seleção de proteína chamado TRAP display, que significa "transcrição-tradução acoplada com associação de ligante de puromicina". Sua abordagem pula duas etapas demoradas em outra técnica comumente usada para pesquisar bibliotecas de proteínas sintéticas. Mas suas investigações indicaram que havia um problema com o ligante de puromicina.

p No estudo atual, a equipe melhorou sua técnica, modificando o ligante de puromicina. Em última análise, eles foram capazes de usar seu TRAP display para identificar nove proteínas sintéticas que se ligam à proteína spike na membrana externa do SARS-CoV-2. A abordagem levou apenas quatro dias, em comparação com as semanas que levaria usando a tecnologia de exibição de RNA mensageiro comumente usada.

p A exibição TRAP envolve o uso de um grande número de modelos de DNA que codificam e sintetizam trilhões de proteínas que transportam sequências peptídicas aleatórias. As proteínas sintéticas são ligadas ao DNA com a ajuda do ligante de puromicina modificado e então expostas a uma proteína-alvo. Quando toda a amostra é lavada, apenas as proteínas sintéticas que se ligam ao alvo permanecem. Estes são então colocados de volta no display TRAP para rodadas adicionais até que apenas um pequeno número de proteínas sintéticas de ligação ao alvo muito específicas sejam deixadas.

p Os pesquisadores investigaram as nove proteínas sintéticas que se ligaram ao SARS-CoV-2. Alguns foram especificamente capazes de detectar SARS-CoV-2 em esfregaços nasais de pacientes com COVID-19, indicando que eles podem ser usados ​​em kits de teste. Um também se liga ao vírus para evitar que ele se ligue aos receptores que usa para obter acesso às células humanas. Isso sugere que essa proteína pode ser usada como estratégia de tratamento.

p "Nossa alta velocidade, A exibição aprimorada do TRAP pode ser útil para a implementação de respostas rápidas a subespécies de SARS-CoV-2 e a outros novos vírus potenciais que causam pandemias futuras, "diz Murakami.

p Este estudo, "Proteínas semelhantes a anticorpos que capturam e neutralizam SARS-CoV-2, "foi publicado online em Avanços da Ciência em 18 de setembro, 2020.