O nível de classificação desenvolvido devido à diversidade de procariote é domínio .

Aqui está o porquê:

* Classificação tradicional: Antes do entendimento da diversidade de procariote, as duas categorias principais eram plantas e animais . Esse sistema, com base em características visíveis, não explica adequadamente os microorganismos.
* Sistema de cinco kingdom: O sistema de cinco kingdom (Monera, Protista, Fungi, Plantae, Animalia) foi proposto por Robert Whittaker em 1969. Reconheceu os procariontes como um reino separado, Monera . No entanto, ainda não capturou completamente a imensa diversidade dentro dos procariontes.
* Sistema de três domínios: Carl Woese, baseado na análise de RNA ribossômico, propôs o sistema de três domínios Em 1977. Este sistema reconheceu que os procariontes são tão fundamentalmente diferentes dos eucariotos que devem ser separados em dois domínios distintos: bactérias e Archaea . Eucariotos formam o terceiro domínio, eukarya .

O desenvolvimento do nível de domínio permitiu uma representação mais precisa das relações evolutivas entre todas as formas de vida. Esse esquema de classificação reconhece a vasta diversidade dentro dos procariontes e reconhece sua história evolutiva única.