O processo que ocorreu com frequência na história inicial dos três domínios na Terra e dificulta a determinação das relações filogenéticas que o tempo é difícil de transferir o gene horizontal (HGT) .

Aqui está o porquê:

* Early Earth foi uma sopa de compartilhamento de genes: Nos primeiros dias da vida na Terra, o ambiente era muito diferente. Os organismos eram mais simples e as membranas celulares eram mais permeáveis. Isso permitiu a troca livre de material genético entre diferentes linhagens, mesmo entre domínios.
* embaçar as linhas de ancestralidade: O HGT é a transferência de material genético entre organismos que não estão diretamente relacionados através da descida. Esse processo obscurece as linhas da ascendência tradicional, dificultando a rastreamento da história evolutiva de um gene ou organismo.
* Histórias evolutivas complicadas: O HGT introduz relações evolutivas complexas, onde um gene em um organismo pode ter se originado de uma linhagem completamente diferente. Isso dificulta a reconstrução da árvore da vida baseada apenas nas sequências genéticas.

Para resumir: Enquanto a transferência de genes vertical (do pai para a prole) é o modo principal de herança, o HGT foi um fator significativo na evolução precoce da vida na Terra. Complica significativamente os esforços para entender as relações evolutivas entre os três domínios (bactérias, Archaea e Eukarya).