A afirmação de que as archaea está mais intimamente relacionada aos eucariotos do que as bactérias é apoiada por uma quantidade substancial de evidência , proveniente principalmente da análise de dados moleculares . Aqui está um colapso da evidência principal:

1. Evidência genômica e molecular:

* RNA ribossômico (rRNA) Estrutura: Archaea e eucariotos compartilham uma estrutura de rRNA mais semelhante em comparação com as bactérias. Essa foi uma das primeiras evidências sugerindo seu relacionamento próximo.
* Síntese de proteínas: Tanto o Archaea quanto os eucariotos usam um conjunto semelhante de fatores de iniciação e alongamento para a síntese de proteínas, enquanto as bactérias usam um conjunto distinto.
* Organização do gene: Archaea possui genes organizados em operons como bactérias, mas os operons em Archaea são mais semelhantes em estrutura aos encontrados nos eucariotos.
* histonas: Enquanto as bactérias carecem de histonas, as archaea possuem proteínas do tipo histona que ajudam a organizar seu DNA, um recurso semelhante aos eucariotos.
* Estrutura da membrana celular: Os archaea têm lipídios únicos da membrana que são mais semelhantes aos lipídios eucarióticos do que os lipídios bacterianos.

2. História evolutiva:

* Análise filogenética : Árvores filogenéticas baseadas em vários marcadores moleculares (rRNA, sequências de proteínas) colocam consistentemente o Archaea como o grupo irmão mais próximo dos eucariotos. Isso sugere um ancestral comum para Archaea e eucariotos.
* transferência horizontal de genes: As evidências sugerem que houve uma extensa transferência horizontal de genes entre os Archaea e os eucariotos, particularmente nos estágios iniciais de sua evolução.

3. Recursos metabólicos e celulares:

* Caminhos metabólicos: Archaea e eucariotos compartilham algumas vias metabólicas não encontradas em bactérias, como a capacidade de fixar o gás nitrogênio.
* Divisão de células: O mecanismo da divisão celular em Archaea é mais semelhante aos eucariotos do que às bactérias.
* Transcrição e tradução: Enquanto as bactérias usam um sistema mais simples para esses processos, os archaea e eucariotos têm máquinas mais complexas.

No entanto, é importante observar que:

* Archaea e eucariotos são domínios distintos da vida: Eles não estão simplesmente "intimamente relacionados" - são galhos separados na Árvore da Vida.
* A relação evolutiva entre Archaea e Eucariotos é complexa: Embora haja fortes evidências de seu relacionamento próximo, também existem diferenças entre eles. Alguns pesquisadores acreditam que o último ancestral comum de Archaea e eucariotos provavelmente foi mais complexo do que se pensava anteriormente.

O entendimento atual é que os archaea e eucariotos compartilham um ancestral comum que divergiu da linhagem que leva a bactérias. Isso torna os archaea mais intimamente relacionados aos eucariotos do que às bactérias. No entanto, a natureza específica desse relacionamento e os eventos evolutivos que levaram à diversificação desses domínios ainda estão sendo estudados ativamente.