Na transcrição, a fita modelo de DNA serve como guia para a síntese de RNA mensageiro (mRNA) por pareamento de bases complementares com ribonucleotídeos. Durante este processo, bases nitrogenadas específicas na fita de DNA emparelham-se com suas bases complementares nos ribonucleotídeos que chegam. Aqui estão as regras de emparelhamento de bases durante a transcrição:

- Adenina (A) nos pares de fitas do modelo de DNA com Uracila (U) na fita de RNA.
- Timina (T) na fita modelo de DNA permanece desemparelhado, pois não há base correspondente no RNA.
- Citosina (C) nos pares de fitas modelo de DNA com Guanina (G) na fita de RNA.
- Guanina (G) nos pares de fitas modelo de DNA com Citosina (C) na fita de RNA.

Durante a transcrição, uma enzima RNA polimerase lê a fita modelo de DNA na direção 5' para 3' e sintetiza uma molécula de RNA complementar adicionando sequencialmente ribonucleotídeos na direção 5' para 3'. Este mecanismo de emparelhamento de bases garante que o transcrito do RNA seja uma cópia precisa do modelo de DNA, exceto pela presença de Uracila (U) no lugar de Timina (T), tornando-o adequado para tradução em proteínas.