Embora os códigos de barras de DNA sejam geralmente precisos para a identificação de espécies, sua eficácia e precisão podem ser afetadas por vários fatores. Aqui estão alguns cenários em que os códigos de barras de DNA podem não ser totalmente precisos:
1. Bancos de dados de referência incompletos ou rotulados incorretamente:A precisão dos códigos de barras de DNA depende fortemente da abrangência e da identificação correta das sequências de referência. Se a base de dados de referência estiver incompleta ou contiver sequências mal rotuladas, poderá levar a identificações incorretas. Isto é particularmente desafiador para espécies recentemente descobertas ou pouco estudadas que podem não estar representadas na base de dados.
2. Variação Intraespecífica:A precisão do código de barras do DNA pressupõe que a variação genética dentro de uma espécie (variação intraespecífica) é menor em comparação com a divergência genética entre espécies (variação interespecífica). No entanto, em certos casos, a variação intraespecífica pode ser elevada, levando a sobreposições entre as sequências de códigos de barras do DNA das espécies. Isto pode dificultar a diferenciação entre espécies estreitamente relacionadas ou crípticas.
3. Indivíduos Híbridos:A hibridização, o cruzamento de espécies distintas, pode resultar em indivíduos com origens genéticas mistas. A análise de códigos de barras de DNA de indivíduos híbridos pode ser desafiadora, pois eles podem exibir padrões intermediários ou em mosaico, dificultando sua atribuição a uma única espécie.
4. DNA antigo ou degradado:Ao trabalhar com amostras de DNA antigas ou degradadas, a qualidade e a quantidade do DNA obtido podem ser comprometidas. Isto pode afetar a precisão do código de barras do DNA, uma vez que o DNA degradado pode ter sequências ausentes ou danificadas que podem afetar a identificação das espécies.
5. Contaminação Ambiental:A amostragem de DNA ambiental (eDNA) envolve a coleta de material genético de fontes ambientais como solo, água ou ar. No entanto, as amostras de eDNA são vulneráveis à contaminação por organismos não-alvo, levando a falsos positivos ou identificação incorreta de espécies.
6. Introgressão mitocondrial:Em certos casos, o DNA mitocondrial (frequentemente usado para código de barras de DNA) pode ser transferido entre espécies através de hibridização ou outros processos evolutivos. Este fenômeno, conhecido como introgressão mitocondrial, pode resultar em discordância entre a história evolutiva das espécies e a sequência do código de barras do DNA, levando potencialmente a identificações incorretas das espécies.
É crucial reconhecer as limitações e possíveis fontes de erro ao interpretar resultados de códigos de barras de DNA. Os investigadores utilizam frequentemente linhas de evidência adicionais, tais como análises morfológicas, dados ecológicos e sequências de ADN nuclear, para corroborar e validar identificações de códigos de barras de ADN, especialmente quando lidam com casos desafiantes ou incertos.