Título: Montando o transcriptoma de uma erva daninha nociva:novos recursos para estudar como as plantas invadem

Autores:

*João Smith
* Jane Doe
*Michael Jones

Afiliações:

* Departamento de Biologia Vegetal, Universidade da Califórnia, Davis
* Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva, Universidade do Arizona

Resumo:

As plantas invasoras são uma grande ameaça aos ecossistemas naturais em todo o mundo. Eles podem competir com as plantas nativas por recursos, como água e luz solar, e também podem alterar a química do solo e a hidrologia de uma área. Isto pode ter um impacto devastador nas comunidades de plantas nativas e nos animais que delas dependem.

Um dos principais fatores que permitem o sucesso das plantas invasoras é a sua capacidade de adaptação a novos ambientes. Muitas vezes, isso se deve a alterações na expressão genética, que podem levar a alterações nas características das plantas, como taxa de crescimento, tamanho das folhas e estrutura das raízes.

Para entender como as plantas invasoras se adaptam a novos ambientes, precisamos ter uma compreensão detalhada do seu transcriptoma. O transcriptoma é a coleção de todas as moléculas de RNA produzidas por uma célula. Ao estudar o transcriptoma, podemos identificar os genes que estão sendo expressos e como sua expressão muda em resposta a diferentes condições ambientais.

Neste estudo, montamos o transcriptoma de uma erva daninha nociva, _Centaurea maculosa_. _C. maculosa_ é nativa da Europa e da Ásia e se tornou invasora na América do Norte. É uma grande ameaça para as comunidades de plantas nativas no oeste dos Estados Unidos, onde pode formar povoamentos densos que excluem outras plantas.

Usamos uma combinação de RNA-seq e montagem de novo para gerar uma montagem de transcriptoma de alta qualidade para _C. maculosa_. A montagem contém mais de 100.000 transcrições, que representam a grande maioria dos genes expressos pela planta.

Também realizamos uma análise diferencial de expressão gênica para identificar os genes que são expressos diferencialmente entre _C. maculosa_ plantas que foram cultivadas em diferentes ambientes. Descobrimos que vários genes foram expressos diferencialmente entre plantas cultivadas em um jardim comum e plantas cultivadas em campo. É provável que esses genes estejam envolvidos na resposta da planta a diferentes condições ambientais.

A montagem do transcriptoma e a análise diferencial da expressão gênica que geramos neste estudo fornecem novos recursos valiosos para estudar como _C. maculosa_ e outras plantas invasoras se adaptam a novos ambientes. Estes recursos irão ajudar-nos a compreender os mecanismos que permitem o sucesso das plantas invasoras e a desenvolver novas estratégias para controlar a sua propagação.

Palavras-chave:

* Montagem do transcriptoma
*Expressão genética
* Plantas invasoras
* _Centaurea maculosa_