As principais diferenças entre machos e fêmeas são os cromossomos X e Y. Entre os humanos, dois cromossomos X formam uma mulher, e um cromossomo X e Y formam um homem. No entanto, existem outras características diferenciadoras entre esses cromossomos. Algumas diferenças incluem tamanho, número de genes e até pares anormais de cromossomos. Em algumas espécies, os animais têm um sistema diferente de determinação do sexo, pois usam um cromossomo Z e W.

Genes de Trabalho

Enquanto o cromossomo Y masculino e o cromossomo X feminino diferem em tamanho, eles também variam no número de genes em funcionamento no cromossomo. O cromossomo X contém mais de 1.000 genes ativos, e o cromossomo Y possui menos de 100 genes ativos. Embora os machos tenham um cromossomo X, ele se comporta de maneira muito diferente quando há outro cromossomo X presente em comparação com seu comportamento quando um cromossomo Y está presente. Dos genes de trabalho no cromossomo X, 200 a 300 são exclusivos para o sexo, portanto, apenas 700 a 800 dos genes de trabalho são compartilhados e ativos em homens e mulheres.
Tamanho

O tamanho real de os cromossomos diferem entre machos e fêmeas. Verificou-se que vários pares de cromossomos nos machos eram maiores do que os das fêmeas quando os cromossomos das ovelhas foram investigados. As diferenças nos tamanhos dos cromossomos podem ser fundamentais para explicar algumas diferenças entre os sexos que não são explicadas pelo cromossomo X ou Y.
Temperatura

Algumas espécies, como lagartos, mariposas, pássaros e vermes achatados, têm genes diferentes para determinação do sexo que X e Y. Esses genes são Z e W. O genótipo ZZ produz machos e o ZW produz fêmeas. A determinação do sexo em algumas dessas espécies é direcionada pela temperatura. Sabe-se que altas temperaturas ditam o sexo do animal. Por exemplo, altas temperaturas de incubação para ovos de jacaré promovem genótipos masculinos, ZZ. No entanto, em muitos lagartos e tartarugas, altas temperaturas de incubação favorecem o genótipo feminino, ZW.
Anormalidades sexuais

Existem várias síndromes que criam anormalidades de diferenciação sexual. Mulheres com apenas um cromossomo X têm síndrome de Turner e, se a menina sobreviver ao nascimento, ela experimentará um crescimento anormal e será muito pequena, com dobras extras de pele no pescoço. A síndrome do triplo X ocorre em mulheres com um cromossomo X adicional. Elas são conhecidas como super fêmeas e tendem a ser semelhantes às fêmeas com dois cromossomos X. Homens que nascem com dois cromossomos X e um cromossomo Y têm síndrome de Klinefelter. Esses homens tendem a ser muito femininos e podem até ter vozes agudas. A síndrome XYY ocorre quando os homens têm um cromossomo Y extra. Estes são conhecidos como super machos e tendem a produzir muito mais testosterona do que os machos comuns.