p Pesquisadores da Universidade ITMO e do Centro de Medicina Física e Química desenvolveram um algoritmo capaz de rastrear a disseminação de genes de resistência a antibióticos no DNA da microbiota intestinal e revelaram evidências adicionais de transferência de genes de resistência entre espécies bacterianas. O método pode não apenas contribuir para o desenvolvimento de esquemas terapêuticos eficazes, mas também reduzir a propagação de superbactérias. Os resultados da pesquisa foram publicados em Bioinformática . p Nos últimos anos, a disseminação da resistência aos antibióticos se tornou um problema global de saúde. Como consequência do uso excessivo de antibióticos na medicina e na agricultura, a microbiota intestinal acumula genes de resistência a antibióticos em seu DNA ou metagenomas. Por um lado, esses genes ajudam a flora normal a sobreviver. Contudo, estudos recentes mostram que a microbiota intestinal é capaz de compartilhar genes de resistência com patógenos, tornando-os resistentes às terapias disponíveis. Nesta Luz, estudar a disseminação de genes de resistência é especialmente importante.

p Programadores da ITMO University com colegas do Centro de Pesquisa de Medicina Física e Química desenvolveram um algoritmo chamado MetaCherchant que torna possível explorar o ambiente do gene de resistência a drogas e ver como ele muda dependendo das espécies de bactérias. “Criamos uma ferramenta que permite aos cientistas olhar mais de perto a diferença entre os arredores do gene em duas ou mais amostras de microbiota. Podemos analisar amostras de microbiota coletadas de pessoas diferentes ou da mesma pessoa em momentos diferentes, por exemplo, antes e depois do tratamento com antibióticos, "diz Vladimir Ulyantsev, professor associado do Departamento de Tecnologias da Computação da Universidade ITMO. "Com base nos dados obtidos, podemos sugerir como um determinado gene de resistência poderia se espalhar de uma espécie microbiana para outra. "

p Os estudos do ambiente do gene de resistência a antibióticos são principalmente importantes para a concepção de esquemas eficazes de tratamento antimicrobiano. "Usando MetaCherchant, podemos analisar como a microbiota contribui para a disseminação da resistência a uma classe particular de antibióticos. Esperando ansiosamente, é possível prever os antibióticos aos quais os patógenos têm maior probabilidade de disseminar a resistência. Por outro lado, também podemos encontrar drogas com baixo risco de resistência. Esse, por sua vez, nos ajudará a ajustar e ajustar terapias específicas. Esta é a questão dos próximos anos, "diz Evgenii Olekhnovich, autor principal e pesquisador do Centro de Medicina Física e Química.

p As aplicações potenciais do algoritmo não se limitam à análise de genes da microbiota intestinal, uma vez que o programa também pode ser usado para estudar amostras de genoma do solo, água ou esgoto. "Podemos avaliar a disseminação da resistência em uma única comunidade bacteriana, como a microbiota intestinal, bem como entre diferentes comunidades. Isso nos permite, por exemplo, para identificar caminhos globais de resistência a antibióticos espalhados pelo meio ambiente, "diz Evgenii Olekhnovich." O problema da resistência é complexo e requer uma abordagem complexa, onde nossa ferramenta pode ser realmente útil. "