As arquebactérias e eubactérias (agora chamadas bactérias) são encontradas na base da árvore de filogenia porque são consideradas as formas de vida mais antigas na terra.

Aqui está o porquê:

* formas de vida precoce: Os cientistas acreditam que a vida na terra surgiu de um único ancestral comum. Archaea e bactérias são os dois domínios mais antigos e primitivos da vida, o que significa que eles divergiram desse ancestral comum muito cedo na história da vida.
* estruturas simples: Tanto o archaea quanto a bactéria são procarióticos, o que significa que não possuem um núcleo e outras organelas ligadas à membrana encontradas em células mais complexas. Essa simplicidade sugere que eles estão mais próximos das formas de vida originais e primitivas.
* Evidência molecular: Análises genéticas e moleculares, particularmente a comparação das seqüências de RNA ribossômico (rRNA), apoiam fortemente a colocação de archaea e bactérias na base da árvore. Essas análises mostram que eles têm linhagens evolutivas distintas que divergiram muito cedo.
* adaptações extremófilas: Muitas arqueias e bactérias vivem em ambientes extremos, como fontes termais, piscinas ácidas e respiradouros em mar. Isso sugere que eles são adaptados a condições semelhantes ao início da Terra, que era muito diferente do ambiente de hoje.

Filogenia moderna:

É importante observar que a classificação desses organismos evoluiu ao longo do tempo.

* Sistema de três domínios: Na década de 1970, o sistema de três domínios de classificação de vida foi proposto por Carl Woese. Esse sistema reconheceu o Archaea como um domínio distinto separado de bactérias e eukarya (organismos com um núcleo).
* Relacionamentos evolutivos: O entendimento atual é que as archaeias e bactérias, embora distintas, estão mais intimamente relacionadas entre si do que aos eucariotos. É por isso que eles são frequentemente mostrados como grupos irmãs na base da árvore de filogenia.

Portanto, a colocação de archaea e bactérias no fundo da árvore filogenética reflete suas origens antigas e papel fundamental na diversificação da vida na Terra.