p Se você está procurando uma agulha em um palheiro, é melhor saber como é o feno. Uma equipe internacional de pesquisadores aplicou essa ideia na busca por novos produtos farmacêuticos, desenvolver uma técnica que reduza as chances de simplesmente redescobrir compostos conhecidos. p Em artigo publicado hoje na revista Nature Communications , pesquisadores da Carnegie Mellon University; a Universidade da Califórnia, San Diego; e a Universidade Estadual de São Petersburgo, na Rússia, descrevem um novo meio de pesquisar vastos repositórios de compostos produzidos por micróbios. Ao analisar os espectros de massa dos compostos, eles foram capazes de identificar compostos conhecidos dentro do repositório e eliminá-los de análises posteriores, concentrando-se, em vez disso, nas variantes desconhecidas - as agulhas dentro do palheiro - que podem ser antibióticos melhores ou mais eficientes, drogas anticâncer ou outros produtos farmacêuticos.

p Em apenas uma semana, rodando em 100 computadores, o algoritmo, chamado Dereplicator +, classificado através de um bilhão de espectros de massa na rede molecular Global Natural Products Social na UC San Diego e identificou mais de 5, 000 promissores, compostos desconhecidos que merecem investigação adicional, disse Hosein Mohimani, professora assistente do Departamento de Biologia Computacional da CMU e primeira autora do artigo.

p O algoritmo que alimenta este mecanismo de busca molecular agora está disponível para uso por qualquer investigador para estudar repositórios adicionais.

p No passado, Os repositórios de dados de espectrometria de massa têm sido subutilizados porque era difícil pesquisá-los e porque os esforços até agora foram prejudicados por altas taxas de redescoberta de compostos conhecidos.

p "É inacreditável quantas vezes as pessoas redescobriram a penicilina, "Mohimani disse.

p Analisando os espectros de massa dos compostos - essencialmente, uma medição das massas dentro de uma amostra que foi ionizada - é uma forma relativamente barata de identificar possíveis novos produtos farmacêuticos. Mas as técnicas existentes eram amplamente limitadas a peptídeos, que possuem estruturas simples, como correntes e laços.

p "Estávamos apenas olhando para a ponta do iceberg, "Mohimani disse.

p Para analisar o maior número de compostos complexos que têm estruturas emaranhadas e numerosos loops e ramos, os pesquisadores desenvolveram um método para prever como um espectrômetro de massa separaria as moléculas. Começando com os anéis mais fracos, o método simulava o que aconteceria quando as moléculas se separassem. Usando 5, 000 compostos conhecidos e seus espectros de massa, eles treinaram um modelo de computador que poderia então ser usado para prever como outros compostos se decomporiam.

p Mohimani disse que o Dereplicator + não só pode identificar compostos conhecidos que não precisam ser investigados mais detalhadamente, mas também pode encontrar variantes menos comuns dos compostos conhecidos que provavelmente não seriam detectados em uma amostra.