produtos químicos usados na extração de DNA:
1. Buffer de lise: *
função: Quebra células abertas e libera o DNA.
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componentes: *
detergente: Interrompe as membranas celulares (por exemplo, SDS, Triton X-100).
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sal: Ajuda a neutralizar moléculas carregadas e estabiliza o DNA (por exemplo, NaCl).
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buffer Tris: Mantém pH para atividade enzimática ideal.
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EDTA: Agente quelante que se liga a cátions divalentes como magnésio, impedindo a degradação do DNA por DNases.
2. Proteinase K: *
função: Digestas proteínas, incluindo histonas que se ligam ao DNA.
* Mecanismo
: Uma serina protease que cliva ligações peptídicas dentro das proteínas.
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Objetivo: Remove proteínas que podem interferir no isolamento e purificação do DNA.
3. Fenol/clorofórmio: *
função: Separa o DNA das proteínas e outros detritos celulares.
* Mecanismo
: O fenol desnature as proteínas e as torna insolúveis, enquanto o clorofórmio atua como um desnaturante e ajuda a separar as fases aquosas e orgânicas.
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Procedimento: Após agitação vigorosa, a mistura se separa em três camadas:
* Camada superior:fase aquosa contendo DNA.
* Camada média:interfase contendo proteínas desnaturadas.
* Camada inferior:fase orgânica contendo fenol/clorofórmio.
* O DNA é recuperado da camada aquosa.
4. Etanol/isopropanol: *
função: Precipita o DNA da solução.
* Mecanismo
: O DNA é solúvel em água, mas insolúvel em etanol ou isopropanol. Quando adicionados, esses álcoois reduzem a solubilidade do DNA, fazendo com que ele precipite fora da solução.
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Procedimento: Após adicionar etanol ou isopropanol, a mistura é centrifugada para coletar o sedimento de DNA.
5. Te buffer: *
função: Re-suspende e armazena o DNA após a extração.
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componentes: *
buffer Tris: Mantém o pH para a estabilidade ideal do DNA.
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EDTA: Agente quelante que inibe DNases.
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Objetivo: Garante que o DNA permaneça intacto e protegido da degradação durante o armazenamento.
6. RNase A: *
função: Remove a contaminação do RNA.
* Mecanismo
: Uma enzima que degrada especificamente o RNA.
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Objetivo: Garante uma amostra de DNA pura para aplicações a jusante, como PCR ou sequenciamento.
Nota: Alguns protocolos podem usar outros produtos químicos, como cloridrato de guanidina ou tiocianato de guanidina para lise, ou colunas de sílica para ligação e purificação do DNA em vez de fenol/clorofórmio.