Os principais elementos encontrados na matéria orgânica são:

* carbono (c) :A espinha dorsal de todas as moléculas orgânicas.
* hidrogênio (h) :Encontrado em todas as moléculas orgânicas, geralmente em grandes quantidades.
* oxigênio (O) :Presentes em muitas moléculas orgânicas, incluindo carboidratos, lipídios e proteínas.
* nitrogênio (n) :Um componente -chave de proteínas e ácidos nucleicos.
* fósforo (P) :Encontrado em ácidos nucleicos, fosfolipídios e ATP (transportador de energia).
* enxofre (s) :Presentes em alguns aminoácidos (cisteína e metionina) e algumas proteínas.

Esses elementos são frequentemente referidos como chonps (pronunciado "idiotas"). Embora não seja tão abundante quanto os seis primeiros, outros elementos como cálcio (CA), magnésio (mg), potássio (k) e sódio (Na) Também desempenham papéis importantes em certas moléculas orgânicas e processos biológicos.

É importante lembrar que a composição elementar exata da matéria orgânica pode variar muito, dependendo do tipo específico de matéria orgânica. Por exemplo, a matéria vegetal terá uma composição diferente da matéria animal, e a matéria orgânica do solo terá uma composição diferente da matéria orgânica em um lago.