Como o cloro tem maior eletronegatividade do que o hidrogênio no ácido clorídrico (HCl), os elétrons na ligação H-Cl são atraídos para mais perto do átomo de cloro, dando ao Cl uma carga parcial negativa (δ-) e ao H uma carga parcial positiva (δ+) . Esta ligação covalente polar cria uma extremidade de hidrogênio ligeiramente positiva e uma extremidade de cloro ligeiramente negativa na molécula de HCl. Esta polaridade permite que o HCl dissolva outras substâncias polares e lhe confere propriedades ácidas quando dissolvido em água.