A alfa amilase é uma enzima que hidrolisa especificamente as ligações alfa-1,4-glicosídicas no amido, glicogênio ou outros carboidratos relacionados. Essas ligações são encontradas entre moléculas de glicose nesses polissacarídeos. Esta reação de hidrólise decompõe os polissacarídeos em unidades menores, como maltose e dextrina, que podem ser posteriormente metabolizadas pelo organismo.

A ligação hidrolisada pela alfa amilase é uma ligação alfa-1,4-glicosídica, que é um tipo de ligação covalente que liga o primeiro carbono (C1) de uma molécula de açúcar ao quarto carbono (C4) da próxima molécula de açúcar. Esse tipo específico de ligação é encontrado nos polissacarídeos amido e glicogênio, que são constituídos por longas cadeias de moléculas de glicose ligadas por ligações alfa-1,4-glicosídicas.