Descoberta de medicamentos baseada em fragmentos (FBDD) oferece uma abordagem eficiente para os pesquisadores acessarem moléculas complexas para a descoberta de medicamentos. Esta técnica envolve a identificação de pequenas moléculas bioativas conhecidas como fragmentos que se ligam a uma proteína alvo específica. Esses fragmentos servem como pontos de partida para o desenvolvimento de candidatos a medicamentos maiores e mais potentes. O FBDD usa uma variedade de técnicas, incluindo cristalografia de raios X, espectroscopia de ressonância magnética nuclear (NMR) e métodos computacionais, para identificar fragmentos que se ligam à proteína alvo. Uma vez identificados, estes fragmentos podem ser modificados quimicamente e combinados para gerar moléculas maiores e mais complexas que retêm as propriedades de ligação desejadas. Este processo iterativo permite que os pesquisadores explorem com eficiência um vasto espaço químico e identifiquem candidatos promissores a medicamentos para desenvolvimento posterior.

Principais etapas na descoberta de medicamentos baseada em fragmentos (FBDD):

Seleção de destino:
- Identificar um alvo proteico relevante para a doença para a descoberta de medicamentos.

Design da biblioteca de fragmentos:
- Gerar uma biblioteca diversificada de pequenas moléculas semelhantes a drogas, conhecidas como fragmentos, usando química combinatória ou métodos computacionais.

Triagem de fragmentos:
- Triagem da biblioteca de fragmentos em relação à proteína alvo usando técnicas biofísicas, como cristalografia de raios X ou espectroscopia de RMN.

Análise de ocorrências de fragmentos:
- Analisar os modos de ligação e afinidades dos fragmentos para identificar potenciais pontos de partida para o desenho de medicamentos.

Elaboração do fragmento:
- Modifique quimicamente e combine os fragmentos para gerar moléculas maiores e mais complexas que retêm as propriedades de ligação desejadas.

Estudos de relação estrutura-atividade (SAR):
- Realizar estudos SAR para otimizar a potência e seletividade das moléculas derivadas de fragmentos.

Otimização de leads:
- Otimizar ainda mais os compostos principais por meio de rodadas iterativas de design, síntese e testes para melhorar suas propriedades semelhantes às dos medicamentos.

Desenvolvimento pré-clínico e clínico:
- Avaliar a segurança e eficácia dos compostos otimizados em estudos pré-clínicos e avançar candidatos promissores para ensaios clínicos.