p Cristais CODH / ACS obtidos sem oxigênio. A cor marrom vem dos metais naturais abrigados pelas proteínas. Crédito:Instituto Max Planck de Microbiologia Marinha / T. Wagner
p Os gases residuais de muitos ramos da indústria contêm principalmente monóxido de carbono e dióxido de carbono. Hoje em dia, esses gases são simplesmente soprados em nossa atmosfera, mas isso pode mudar em breve. A ideia é usar o poder das bactérias para transformar gases tóxicos de resíduos em compostos valiosos, como acetato ou etanol. Estes podem ser usados posteriormente como biocombustíveis ou compostos básicos para materiais sintéticos. As primeiras plantas de teste em tamanho real já estão em avaliação, usando essa conversão em escala industrial, e as estrelas desse processo são bactérias que devoram monóxido de carbono, dióxido de carbono e dihidrogênio, entre os quais Clostridium autoethanogenum é de longe o favorito. p "Neste micróbio, as principais linhas do metabolismo utilizadas para operar a conversão de gás foram caracterizadas, "diz Tristan Wagner, líder do grupo Microbial Metabolism no Max Planck Institute for Marine Microbiology. "Mas ainda existem muitos pontos de interrogação no nível molecular." O foco dos cientistas de Bremen:Como o monóxido de carbono tóxico é processado pelas enzimas com uma eficiência tão impressionante?
p
Grande surpresa em um cristal
p O conhecimento em nível molecular da conversão de monóxido de carbono é derivado de estudos realizados na espécie Moorella thermoacetica. Este é um organismo modelo marinho conveniente e bem estudado, mas exibe uma capacidade pobre de desintoxicar gases residuais, ao contrário de Clostridium autoethanogenum. Ambas as bactérias usam a mesma enzima para converter o monóxido de carbono:a CO-desidrogenase / acetil-CoA sintase, abreviado como CODH / ACS. É uma enzima muito comum que já existia nos tempos primitivos da Terra. "Uma vez que ambas as espécies usam a mesma enzima para converter o monóxido de carbono, esperávamos ver exatamente a mesma estrutura, com pequenas diferenças, "diz Wagner.
p Para sua pesquisa, Wagner e seu colega Olivier N. Lemaire estão estudando a bactéria Clostridium autoethanogenum para entender como ela pode prosperar na termodinâmica da vida, usando um metabolismo semelhante ao das primeiras formas vivas. Olivier N. Lemaire cultivou a bactéria e purificou seu CODH / ACS na ausência de oxigênio, o que é prejudicial para a enzima. Os dois cientistas usaram o método de cristalização para obter cristais da enzima CODH / ACS e determinar a estrutura 3-D da proteína por cristalografia de raios-X. “Quando vimos os resultados, não podíamos acreditar em nossos olhos, "diz Wagner." A interface CODH-ACS de Clostridium autoethanogenum difere drasticamente do modelo de Moorella thermoacetica, embora fosse a mesma enzima e bactérias semelhantes. "
p O gráfico mostra a bidirecionalidade do complexo CODH / ACS de C. autoethanogenum (CODH em laranja e ACS em roxo). Em condições quimiolitoautotróficas, a enzima pode transformar o dióxido de carbono (CO2) em monóxido de carbono (CO), sequestrado em um canal de gás (topo). O CO será transformado em acetil-CoA, o bloco de construção da célula usado para obter energia celular e construir o material da célula. Durante o processo de conversão de gás, o CO liberado pela atividade industrial pode ser utilizado de forma muito eficiente pelo CODH / ACS (abaixo). É capturado por numerosos canais de gás e irá gerar Acetil-CoA e energia química ao mesmo tempo, permitindo que a célula ganhe vida com CO. Crédito:O. Lemaire e T. Wagner. As imagens sem direitos autorais usadas foram obtidas na National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA) e na biblioteca de fotos Pexel (Black Smoker; NOAA Office of Ocean Exploration and Research, 2016 Exploração em Águas Profundas das Marianas; Fotografia de fábrica por Chris LeBoutillier
p
Mesmos ingredientes, arquitetura diferente
p Após, os dois pesquisadores realizaram mais experimentos para provar que a primeira estrutura não era um artefato, mas a realidade biológica. Os experimentos seguintes confirmaram o modelo inicial. Assim, a descoberta prova claramente que está errada a suposição anterior de que a enzima CODH / ACS sempre tem a mesma estrutura geral. "A enzima de Moorella thermoacetica tem uma forma linear, "explica Olivier N. Lemaire, primeiro autor do estudo, que foi publicado recentemente na revista científica
Bioenergética BBA . "Em Moorella thermoacetica, a enzima produz monóxido de carbono no CODH e usa no ACS. Entre eles, ele é preso e canalizado através de um canal de gás selado. ACS acabará por sintetizar acetil-CoA, um bloco de construção posteriormente processado em acetato e etanol. O resto da célula não vê nenhum monóxido de carbono. "
p Mas o Clostridium autoethanogenum absorve o monóxido de carbono diretamente. "No Clostridium autoethanogenum a enzima CODH / ACS não tem apenas uma abertura, mas vários. Desta forma, ele pode coletar tanto monóxido de carbono quanto possível e conduzi-lo para um sistema completo de túneis, operando em ambas as direções, "diz Lemaire." Esses resultados mostram uma reorganização dos túneis de gás internos durante a evolução dessas bactérias, supostamente levando a um complexo bidirecional que garante um alto fluxo de conversão de monóxido de carbono em direção à conservação de energia e assimilação de monóxido de carbono, atuando como a principal força motriz celular. “Ao final do processo também são gerados acetato e etanol, que podem ser usados para produzir combustíveis.
p "Agora temos uma imagem de como é essa enzima muito eficiente e robusta, "diz Tristan Wagner." Mas nossa descoberta é apenas um passo adiante. Entre outras coisas, ainda é uma questão em aberto como a bactéria pode sobreviver e usar monóxido de carbono para alimentar todas as suas necessidades de energia celular. Temos algumas hipóteses, mas ainda estamos no começo. Para entender todo o processo químico de conversão de monóxido de carbono em acetato e etanol, outras proteínas precisam ser estudadas. "