Os pesquisadores identificam a formação pós-tradução de ciclofanos tensos em bactérias
p A Figura mostra macrociclos que são criados pelas enzimas formadoras de ciclofano de três resíduos (3-CyFEs). A nova ligação é mostrada em azul e destacada em ciano. A família de produtos naturais produzidos por 3-CyFEs é conhecida como triceptídeos.
p Os pesquisadores do NUS identificaram enzimas modificadoras pós-tradução em bactérias que podem criar uma nova família de peptídeos cíclicos para novas terapêuticas. p Os peptídeos cíclicos são uma classe bem conhecida de moléculas que possuem uma gama de atividades biológicas, incluindo antibacteriana, propriedades imunossupressoras e anticancerígenas. O desafio de criar novos tipos de peptídeos cíclicos está na descoberta de novas reações catalíticas por síntese química ou pelo uso de enzimas. Uma estratégia para conseguir isso envolve a formação de ligações carbono-carbono (C-C). Contudo, As reações de formação de ligações C-C em ligações de carbono-hidrogênio (C-H) não ativadas são difíceis porque essas posições são inertes, e a seletividade não é fácil de controlar. A superação dessas barreiras permitirá a criação de uma nova gama de peptídeos cíclicos de forma eficiente e previsível.
p A equipe de pesquisa liderada pelo Prof Brandon Morinaka do Departamento de Farmácia, A NUS encontrou reações catalisadas por um conjunto de enzimas modificadoras pós-tradução de várias bactérias que podem ser usadas para desenvolver moléculas de drogas importantes. Essas enzimas podem catalisar a formação de um C (aril) -C (
sp
3
) ligação entre as cadeias laterais de dois aminoácidos. Este arranjo molecular é a característica definidora de uma classe de produtos naturais denominados triceptídeos (três resíduos nos peptídeos ciclofanos) (veja a figura). A reação de fechamento do anel resulta na formação de ciclofanos peptídicos tensos. Embora essas enzimas sejam codificadas em várias centenas de genomas bacterianos, sua função e seus produtos finais permaneceram amplamente desconhecidos.
p Essas enzimas oferecem uma nova estratégia para a modificação de peptídeos e podem ser aplicadas para gerar peptídeos terapêuticos que apresentam ligação única a alvos moleculares. A ciclização de peptídeos é uma estratégia geral usada na natureza e na química sintética para prevenir a degradação pelas enzimas digestivas. A prevenção da degradação é um atributo essencial necessário para que as drogas atinjam seu alvo e representa um obstáculo ao uso de peptídeos como drogas.
p Essas enzimas são capazes de instalar os anéis em uma variedade de padrões com diferentes aminoácidos. Isso significa que a variedade de produtos é potencialmente grande e pode ser aplicada a diversos alvos na descoberta de medicamentos. Descobriu-se que diversas bactérias de uma variedade de microbiomas codificam as enzimas formadoras de ciclofano. A diversidade de produtos sugere que os ciclofanos peptídicos são mais prevalentes do que se conhecia anteriormente e podem conferir um uso ou função geral entre essa classe de produtos naturais.
p A equipe planeja produzir produtos naturais de tríceptídeos adicionais e entender o mecanismo enzimático. Seus objetivos de longo prazo são gerar uma ampla gama de produtos de ciclofano peptídeo que podem ser usados como um ponto de partida para direcionar doenças de interesse.
p Prof Morinaka disse, "As enzimas formadoras de ciclofano pós-tradução oferecem um novo método para a criação de diversos peptídeos cíclicos que fornecem novas oportunidades em engenharia de peptídeos e descoberta de drogas."