O aprendizado de máquina revela novos materiais candidatos para eletrônicos biocompatíveis
p Ferramentas de aprendizado de máquina desenvolvidas pela Assoc. O Prof. Andrew Ferguson e seus colaboradores são capazes de selecionar peptídeos de automontagem para encontrar os melhores candidatos para eletrônica, materiais biocompatíveis. Crédito:Kirill Shmilovich et al.
p Cientistas e engenheiros estão em uma busca para desenvolver dispositivos eletrônicos que sejam compatíveis com nossos corpos:pense em materiais que podem ajudar a conectar os neurônios novamente após lesões cerebrais, ou ferramentas de diagnóstico que podem ser facilmente absorvidas pelo corpo. p Uma família de peptídeos de automontagem, chamados oligopeptídeos conjugados com π, tem se mostrado promissor ao se tornar a base da próxima geração desses eletrônicos, materiais biocompatíveis. Mas identificar as sequências moleculares corretas para criar as nanoestruturas automontadas ideais exigiria o teste de milhares de possibilidades, cada uma delas levando aproximadamente um mês para serem testadas em laboratório.
p Assoc. O Prof. Andrew Ferguson e seus colaboradores aceleraram esse processo, desenvolvendo ferramentas de aprendizado de máquina que podem selecionar os melhores candidatos. Pela triagem 8, 000 candidatos de peptídeos automontados, a equipe foi capaz de classificar cada design. Isso abre caminho para que experimentalistas testem os candidatos mais promissores.
p Os resultados foram publicados em
The Journal of Physical Chemistry B . O artigo também foi selecionado como a Escolha dos Editores da ACS, que oferece acesso público gratuito a novas pesquisas importantes para a comunidade científica global, e para ser destaque na capa do jornal.
p "Ao compreender a ciência de dados, Ciência de materiais, e ciência molecular, conseguimos encontrar uma maneira inovadora de selecionar novos candidatos possíveis, "Ferguson disse." O fato de que este artigo foi escolhido como uma Escolha dos Editores da ACS mostra que há muito interesse em acoplar inteligência artificial à ciência de domínio. É um problema importante de amplo interesse para a comunidade físico-química. "
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Classificação de peptídeos para experimentalistas
p Para ajudar a encontrar os melhores candidatos, Ferguson e o estudante de graduação Kirill Shmilovich examinaram uma família de oligopeptídeos conjugados com π usando aprendizado de máquina e simulação molecular. O conjunto incluiu 8, 000 peptídeos potenciais, se os pesquisadores mantivessem o mesmo núcleo e apenas mudassem os três aminoácidos de cada lado da molécula. (Os aminoácidos nas laterais são simétricos - se você mudar um de um lado, muda do outro lado, também.)
p Usando uma forma de aprendizado de máquina conhecida como aprendizado ativo ou otimização Bayesiana para guiar as simulações moleculares, eles foram capazes de construir modelos baseados em dados confiáveis de como a sequência do peptídeo influenciou suas propriedades após considerar apenas 186 peptídeos.
p As previsões do modelo poderiam então ser extrapoladas de forma confiável para prever as propriedades do resto da família de peptídeos. O processo também removeu o preconceito humano da equação, permitir que a inteligência artificial encontrasse características de designs de peptídeos que os pesquisadores não haviam considerado antes, que na verdade os tornava candidatos melhores.
p Eles então classificaram cada peptídeo e entregaram seus resultados aos seus colaboradores experimentais, que testará os melhores candidatos no laboratório. Próximo, eles esperam expandir seu sistema para incluir a experimentação de diferentes núcleos conjugados com π, enquanto alimentam novos dados experimentais de volta ao loop para fortalecer ainda mais seus modelos.
p Eles também esperam usar este sistema de aprendizado de máquina para projetar proteínas, otimizando coloides de automontagem para fazer cristais atômicos, e até mesmo um dia incorporar essas ferramentas em um laboratório autônomo, onde a inteligência artificial levaria dados, criar previsões, fazer experimentos, em seguida, devolva esses dados ao modelo - tudo sem intervenção humana.
p "Este é um método que pode ser útil em muitos domínios diferentes, "Ferguson disse.