LOCKR é um interruptor molecular feito de várias partes interagindo:uma 'chave' (preta) desbloqueia uma 'gaiola' (cinza), revelando um peptídeo bioativo (amarelo) que pode interagir com outras moléculas na célula. LOCKR, um complexo de proteína sintética, foi projetado computacionalmente do zero, então testado em células vivas. Crédito:Ian Haydon, UW Medicine Institute for Protein Design
Os cientistas criaram o primeiro switch de proteína completamente artificial que pode funcionar dentro das células vivas para modificar - ou mesmo comandar - os complexos circuitos internos da célula.
A opção é apelidada de LOCKR, abreviação de travamento, Ortogonal Cage / Key pRotein.
Artigos complementares publicados em 24 de julho na revista Natureza descrever o design do LOCKR e demonstrar várias aplicações práticas da tecnologia. O trabalho foi conduzido por equipes de bioengenharia lideradas por David Baker no UW Medicine Institute for Protein Design e Hana El-Samad na UC San Francisco.
Os cientistas mostram que o LOCKR pode ser "programado" para modificar a expressão do gene, redirecionar o tráfego de celular, degradam proteínas específicas, e controlar as interações de ligação de proteínas. Os pesquisadores também usam o LOCKR para construir novos circuitos biológicos que se comportam como sensores autônomos. Esses circuitos detectam pistas do ambiente interno ou externo da célula e respondem fazendo alterações na célula. Isso é semelhante à maneira como um termostato detecta a temperatura ambiente e direciona um sistema de aquecimento ou resfriamento para se desligar assim que a temperatura desejada for atingida.
Uma vez montado por uma célula, esses novos interruptores medem apenas oito nanômetros em seu lado mais longo. Mais de cem milhões seriam necessários para cobrir o período no final desta frase.
"A capacidade de controlar células com proteínas projetadas inaugura uma nova era da biologia, "disse El-Samad, o Professor de Bioquímica e Biofísica da Família Kuo na UCSF e co-autor sênior dos relatórios. “Da mesma forma que os circuitos integrados possibilitaram a explosão da indústria de chips de computador, esses interruptores biológicos versáteis e dinâmicos podem em breve desbloquear o controle preciso sobre o comportamento das células vivas e, em última análise, nossa saúde. "
Não tendo contrapartida no mundo natural, LOCKR se destaca de todas as ferramentas do comércio de biotecnologia, incluindo tecnologias recentes como optogenética e CRISPR. Embora seus predecessores tenham sido descobertos na natureza e depois refeitos para uso em laboratórios, indústria, ou remédio, LOCKR está entre as primeiras ferramentas de biotecnologia inteiramente concebidas e construídas por humanos.
Os principais autores dos relatórios são Bobby Langan e Scott Boyken, do UW Medicine Institute for Protein Design, e Andrew Ng do Programa de Pós-Graduação em Bioengenharia da UC Berkeley-UCSF.
"Agora mesmo, cada célula está respondendo ao seu ambiente, "disse Langan." As células recebem estímulos, então tem que descobrir o que fazer sobre isso. Eles usam sistemas naturais para ajustar a expressão gênica ou degradar proteínas, por exemplo."
Langan e seus colegas decidiram criar uma nova maneira de interagir com esses sistemas celulares. Eles usaram o projeto de proteínas computacionais para criar proteínas de automontagem que apresentam peptídeos bioativos somente após a adição de "chaves" moleculares específicas.
Com uma versão do LOCKR instalado no fermento, a equipe conseguiu mostrar que o fungo geneticamente modificado poderia degradar uma proteína celular específica em um momento de escolha dos pesquisadores. Ao redesenhar o switch, eles também demonstraram o mesmo efeito em células humanas cultivadas em laboratório.
Manter-se saudável, as células devem controlar rigidamente seus processos bioquímicos. Atividade anormal em apenas um gene, ou acúmulo da proteína errada, pode perturbar o equilíbrio de uma célula. Isso pode levar à morte celular ou mesmo ao câncer. O LOCKR oferece aos cientistas uma nova maneira de interagir com células vivas. Isso poderia permitir uma nova onda de terapias para doenças tão diversas como o câncer, doenças autoimunes e muito mais.
"LOCKR abre um novo reino de possibilidades para células de programação, "disse Ng." Estamos agora mais limitados pela nossa imaginação e criatividade do que pelas proteínas que a natureza desenvolveu. "