Novo, proteínas projetadas por computador se agrupam em filamentos mais de mil vezes mais finos do que um fio de cabelo humano. Crédito:Ian C. Haydon / Institute for Protein Design
Pela primeira vez, cientistas criaram, do princípio, filamentos de proteínas de auto-montagem.
Estes foram construídos a partir de subunidades de proteínas idênticas que se juntam espontaneamente para formar longas, helicoidal, estruturas semelhantes a fios.
No mundo natural, filamentos de proteínas são componentes essenciais de várias partes estruturais e móveis nas células vivas, bem como muitos tecidos do corpo.
Estes incluem os citoesqueletos que dão forma às células, os microtúbulos celulares que orquestram a divisão celular, e a proteína mais comum em nossos corpos, colágeno, que dá força e flexibilidade à nossa cartilagem, pele e outros tecidos.
"Ser capaz de criar filamentos de proteínas do zero - ou de novo - nos ajudará a entender melhor a estrutura e a mecânica dos filamentos de proteínas que ocorrem naturalmente e também nos permitirá criar materiais inteiramente novos, diferentes de todos os encontrados na natureza, "disse David Baker, professor de bioquímica da University of Washington School of Medicine, e diretor do UW Institute for Protein Design, quem dirigiu o projeto. Ele também é um investigador do Howard Hughes Medical Institute.
Esses componentes proteicos recém-projetados se juntam espontaneamente em filamentos. As proteínas projetadas são relativamente pequenas, composto de apenas cerca de 180 a 200 aminoácidos e mede apenas cerca de um nanômetro de comprimento, mas reúna em filamentos estáveis mais de 10, 000 nanômetros de comprimento. Os filamentos também podem ser ajustados para crescer ou desmontar. Crédito:Institute for Protein Design / UW Medicine
Esses materiais podem incluir fibras feitas pelo homem que igualam ou superam a resistência da seda de aranha, que em peso é mais forte que o aço, Baker disse. Ele também mencionou a possibilidade de circuitos de fios em escala nano.
Para projetar os filamentos, os pesquisadores usaram um programa de computador desenvolvido no laboratório Baker, chamada Rosetta, que pode prever a forma de uma proteína a partir de sua sequência de aminoácidos.
Para funcionar corretamente, as proteínas devem se dobrar em uma forma precisa. Esse dobramento é impulsionado pelas propriedades dos aminoácidos individuais e como eles interagem entre si e com o ambiente fluido circundante. As forças de atração e repulsão levam a proteína a descansar em uma forma que possui o nível de energia mais baixo.
Ao calcular qual forma iria equilibrar essas forças de atração e repulsão para produzir o menor nível de energia total, Rosetta pode prever, com um alto grau de precisão, a forma que uma proteína assumirá na natureza.
Usando Rosetta, os pesquisadores se propuseram a projetar pequenas proteínas com aminoácidos em sua superfície que fariam com que eles se ligassem uns aos outros. Isso permitiu que eles se montassem em uma hélice, alinhando-se como degraus em uma escada em espiral. Para que a hélice seja estável, a proteína projetada se liga a outras cópias posicionadas acima e abaixo dela conforme a hélice se enrola, camada sobre camada.
Concepção artística de unidades de proteína projetadas por computador começando a se automontar para formar filamentos. Crédito:Institute for Protein Design
"Eventualmente, fomos capazes de projetar proteínas que se encaixariam como Legos, "disse Hao Shen, um Ph.D. candidato no UW Molecular Engineering &Sciences Institute. Ele e Jorge Fallas, um instrutor de bioquímica na UW School of Medicine, são os principais autores de um artigo que descreve a abordagem.
Este artigo será publicado online pela revista Ciência na quinta feira, 8 de novembro 2018.
Fallas disse que as proteínas projetadas são relativamente pequenas. Eles são compostos de apenas cerca de 180 a 200 aminoácidos e medem apenas cerca de um nanômetro de comprimento, mas reúna em filamentos estáveis mais de 10, 000 nanômetros de comprimento. Um nanômetro equivale a 1 bilionésimo de um metro, ou aproximadamente a largura de 10 átomos de hidrogênio alinhados lado a lado.
Os pesquisadores também mostraram que, mexendo na concentração da proteína projetada na solução e adicionando tampas que inibem a capacidade de ligação do projeto, eles podem fazer com que os filamentos cresçam ou se desmontem.
"A capacidade de programar a dinâmica da formação do filamento nos dará insights sobre como a montagem e desmontagem do filamento é regulada na natureza, "disse Baker." A estabilidade dessas proteínas sugere que elas podem servir como estruturas facilmente modificáveis para uma gama de aplicações que vão desde novos testes de diagnóstico a nanoeletrônicos. "