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    ChemMaps permite aos pesquisadores navegar no universo químico

    Captura de tela do ChemMaps. Crédito:NC State University

    Pesquisadores da North Carolina State University criaram um novo serviço online - ChemMaps - que permite aos usuários navegar interativamente no espaço químico de mais de 8 pessoas, 000 drogas e 47, 000 compostos ambientais em 3-D e em tempo real. O ChemMaps foi projetado para ser um recurso central para estudantes e pesquisadores que desejam visualizar e estudar conjuntos complicados de estruturas químicas.

    A primeira versão do site gratuito está disponível em http://www.chemmaps.com.

    "A premissa do ChemMaps era torná-lo o Google Maps de drogas, "diz Denis Fourches, professor assistente de química na NC State. “Ele permite que qualquer pessoa que use um computador ou tablet navegue e navegue facilmente no espaço químico dos medicamentos comercializados em um ambiente 3-D. Queríamos muito tornar a interface gráfica do ChemMaps relevante para um aluno ou especialista em química medicinal. "

    Com ChemMaps, os produtos químicos parecem estrelas - pontos de luz espalhados pela tela. Cada estrela, ou composto, está posicionado em relação aos outros dentro do complexo espaço químico com base em suas propriedades estruturais. Quando um usuário clica em uma determinada estrela composta, várias características-chave desse produto químico são exibidas:seu nome sistemático, marca, estrutura química, indicação médica, identificadores externos, e outras propriedades físico-químicas.

    Atualmente, existem dois mapas principais disponíveis. O DrugMap inclui cerca de 8, 000 medicamentos (comercializados, em desenvolvimento e retirado) e foi preparado a partir do banco de dados DrugBank. O mapa ambiental, ou EnvMap, inclui mais de 47, 000 compostos (como pesticidas ou retardadores de chama) de relevância para o Instituto Nacional de Estudos de Saúde Ambiental (NIEHS) e a Agência de Proteção Ambiental dos Estados Unidos (EPA) e foi preparado a partir do Tox21, Toxcast, e outros bancos de dados NIEHS.

    Os pesquisadores planejam adicionar recursos ao longo do tempo, incluindo a capacidade de colaboradores e empresas de visualizar e projetar conjuntos proprietários de produtos químicos nos ChemMaps. Eles também planejam tornar os mapas ainda mais interativos, fácil de manipular, e compatível com dispositivos de realidade virtual e aumentada.

    "Esta é a primeira ferramenta de domínio público que permite a qualquer pessoa, particularmente não especialistas em quimio-informática, para facilmente, acessar visualmente e rapidamente todas essas informações químicas complexas em um só lugar, "Fourches diz." Esta ferramenta pode ajudar os pesquisadores a entender melhor a vizinhança química de um composto específico. Na verdade, isso é crítico para reaproveitamento de medicamentos ou avaliação de risco químico. "

    A pesquisa aparece em Bioinformática . Dr. Alex Borrel, ex-bolsista de pós-doutorado do Estado do NC atualmente no NIEHS e primeiro autor do artigo, criou o programa. Fourches concebeu ChemMaps e é o autor correspondente. Dra. Nicole Kleinstreuer, biólogo computacional do NIEHS, também contribuiu para o trabalho.


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