As duas organelas encontradas em Euglena, mas não em Zooflagellate, são:

1. cloroplastos: Euglena é mixotrófico, o que significa que eles podem obter energia da luz solar (fotossíntese) e de fontes orgânicas. Isso é possível pela presença de cloroplastos, que são os locais da fotossíntese. Os zooflagelados, por outro lado, são heterotróficos e dependem apenas de consumir matéria orgânica.

2. Eyespot: Também conhecida como estigma, o olho é uma organela sensível à luz que ajuda a Euglena a detectar luz e se mover em direção a ele para a fotossíntese. Os zooflagelados não têm vistas para os olhos, pois não confiam na fotossíntese.