Carl Woese propôs separar bactérias e archaea em domínios separados, em vez de apenas reinos por causa de descobertas inovadoras na biologia molecular, especificamente a análise do RNA ribossômico (rRNA). Aqui está o porquê:

1. A análise de rRNA revelou diferenças fundamentais:

* Distância evolutiva: A análise de Woese das sequências de rRNA mostrou que as archaea eram tão diferentes das bactérias quanto de eucariotos. Isso implicava que esses três grupos divergiam de um ancestral comum muito cedo na história da vida.
* Recursos exclusivos: Verificou -se que os archaea possuíam características únicas não compartilhadas por bactérias, como estruturas distintas da parede celular e um conjunto único de vias metabólicas. Isso apoiou ainda mais sua linhagem separada.

2. O sistema tradicional de cinco kingdom era insuficiente:

* simplificação excessiva: O sistema de cinco kingdom (Monera, Protista, Fungi, Plantae, Animalia) agrupou bactérias e archaea como "monera" com base em sua natureza procariótica. Essa classificação não refletiu com precisão as vastas diferenças evolutivas entre esses grupos.
* Relações filogenéticas: O trabalho de Woese revelou que o sistema de cinco rei não representou adequadamente as verdadeiras relações filogenéticas entre os organismos. Estava na hora de um sistema de classificação mais robusto e preciso.

3. Apresentando o sistema de três domínios:

* Classificação refinada: A pesquisa de Woese levou ao estabelecimento do sistema de três domínios, reconhecendo bactérias, Archaea e Eukarya como os ramos fundamentais da vida. Isso refletiu a história evolutiva e a diversidade da vida com mais precisão.
* Fundação para pesquisas futuras: O sistema de três domínios forneceu uma nova estrutura para entender as origens e a evolução da vida, influenciando futuras pesquisas em microbiologia, genética e biologia evolutiva.

Em essência, a pesquisa inovadora de Woese demonstrou a profunda divisão evolutiva entre bactérias e archaea, tornando necessário ir além das limitações do sistema tradicional de cinco rei. O sistema de três domínios, ainda amplamente aceito hoje, oferece uma classificação mais precisa e perspicaz da vida na Terra.