O emparelhamento de bases entre DNA e RNA segue as seguintes regras:

* adenina (a) em pares de DNA com uracil (u) em RNA.
* guanina (g) em pares de DNA com citosina (c) em RNA.

Isso é ligeiramente diferente do emparelhamento de DNA de DNA, onde a adenina em pares com timina (T). O RNA usa uracil em vez de timina.

Então, o emparelhamento de bases é:

* a-u
* g-c