A mutação que menos exigiria o realinhamento de regiões homólogas em um gene comum a várias espécies relacionadas é uma mutação sinônima .

Aqui está o porquê:

* mutações sinônimas são alterações na sequência de DNA que não alteram a sequência de aminoácidos da proteína codificada pelo gene. Isso ocorre porque o código genético é redundante, o que significa que vários códons podem codificar o mesmo aminoácido.
* mutações não sinônimas , por outro lado, altere a sequência de aminoácidos, que pode potencialmente alterar a função e a estrutura da proteína.
* Inserções e deleções (Indels) pode causar mudanças de quadros, levando a mudanças significativas na sequência de proteínas e exigindo um realinhamento extenso.

Como as mutações sinônimas não alteram a sequência de proteínas, elas têm um impacto mínimo na estrutura e função geral do gene. Isso os torna menos propensos a atrapalhar o alinhamento de regiões homólogas em diferentes espécies.

Portanto, uma mutação sinônima exigiria o menos realinhamento de regiões homólogas em um gene comum a várias espécies relacionadas.