Os eucariotos são qualquer tipo de organismo que possui células complexas que incluem mitocôndrias, núcleos e outras partes celulares. Os três principais grupos celulares são fungos, plantas e animais. Muitos fungos estão relacionados apenas às plantas de maneira superficial. Eles podem se parecer com plantas e ter paredes celulares semelhantes às paredes celulares das plantas, mas há uma árvore de frenologia que mostra como os fungos podem estar mais intimamente relacionados aos animais do que às plantas. Como os animais estão mais próximos na história evolutiva dos fungos do que das plantas, pode-se dizer que um cogumelo está mais "parente" de um ser humano do que de vegetais em uma barra de salada.
Proteína

As seqüências de proteínas dos fungos são mais parecidos com animais do que plantas. Por exemplo, a proteína do molde de lodo celular parece mais proteína animal do que proteína vegetal. O comprimento dos ribossomos nos fungos mostra um aminoácido semelhante ao músculo. De fato, existem várias seqüências de aminoácidos que são semelhantes às proteínas da cadeia pesada em mamíferos. Um desses aminoácidos é 81% idêntico ao aminoácido humano.
Clorofila
Celulose vegetal é diferente da celulose fúngica. Quando radiografada, a celulose vegetal é mais cristalina que a celulose fúngica. Os fungos e os animais não contêm cloroblastos, o que significa que nem os fungos nem os animais podem processar a fotossíntese. A clorofila torna as plantas verdes e fornece nutrição às plantas. Por outro lado, os fungos absorvem nutrientes do material vegetal em decomposição por meio de um processo enzimático, e os animais ingerem seus alimentos.
Quitina

Os fungos e os animais contêm uma molécula de polissacarídeo chamada quitina que as plantas não compartilham. A quitina é um carboidrato complexo usado como componente estrutural. Os fungos usam a quitina como elemento estrutural nas paredes celulares. Nos animais, a quitina está contida no exoesqueleto dos insetos e nos bicos dos moluscos. A quitina funciona de maneira semelhante à planta celulose, mas a quitina é mais forte. Estudos realizados em polissacarídeos de fungos mostraram que a adição de álcalis contendo nitrogênio destruía fungos e produzia ácido acético. Essas reações químicas não ocorreram nos polissacarídeos das plantas.
Os fungos não são algas
As algas são as plantas mais simples e primitivas. Em 1955, o Dr. George W. Martin concluiu que os fungos eram derivados de algas que haviam perdido a clorofila. No entanto, a hipótese de Martin não considerou que as condições atmosféricas poderiam ter sido diferentes quando a vida começou do que eram em 1955. Além disso, Martin não levou em consideração que as bactérias fixadoras de nitrogênio poderiam ter existido mesmo antes da evolução das plantas, o que poderia ter sido usado. como fonte de alimento para os fungos. Em 1966, o Dr. A.S. Sussman observou que, embora os fungos parecessem superficialmente algas, havia aspectos de fungos, como núcleos e organização celular, que não podiam ser explicados.
Esteróis

Alguns biólogos citaram que os esteróis animais e fúngicos são diferentes , portanto, os fungos não podem ser semelhantes aos animais. Os animais produzem colesterol, enquanto os fungos produzem ergosterol. Após uma análise mais detalhada, os esteróis de fungos e animais contêm lanosterol, enquanto os fitoesteróis nas plantas verdes contêm cicloartenol.
Sua própria categoria?

Talvez os fungos não sejam derivados de plantas nem animais unicelulares. Alguns biólogos argumentaram que os fungos são filogeneticamente distintos de todos os outros eucariotos. Os fungos parecem ser únicos, pois exigem um fator de alongamento da tradução chamado EF-3. Existem algumas atividades proteicas essenciais para o alongamento da tradução in vivo.