Cromossomos lineares são encontrados apenas em alguns Actinomicetos. Streptomyces é uma bactéria Gram-positiva com alto teor de GC. Possui um cromossomo linear variando de 6 a 10 Mb de tamanho e vários plasmídeos circulares com tamanho total de 1-10% do DNA cromossômico. Os estreptomicetos exibem um ciclo de vida complexo envolvendo fases de crescimento assexuadas e sexuais e são conhecidos por sua extensa produção de metabólitos secundários bioativos quimicamente diversos.

É necessário linearizar o cromossomo para que os replicons individuais sejam resolvidos no gel do campo de pulso. Os replicons são separados pelo CHEF com base no tamanho. Geralmente é executado por um longo período de tempo, geralmente de 20 a 30 horas, para obter uma boa resolução.

Aqui estão as etapas para dobrar um cromossomo linear de Streptomyces:

1. Prepare o gel de agarose. Faça um gel de agarose a 1% em tampão TBE 0,5X.
2. Carregue a amostra de DNA. Misture a amostra de DNA com tampão de carga 6X e carregue-a no gel de agarose.
3. Execute o gel. Execute o gel a 14°C por 20-30 horas a 2 V/cm.
4. Visualize o DNA. Mancha o gel com brometo de etídio e visualize o DNA sob luz UV.
5. Dobre o cromossomo. O cromossomo linear de Streptomyces aparecerá como uma única faixa grande no gel. Para dobrar o cromossomo, corte a faixa do gel e coloque-a sobre um pedaço de Parafilm.
6. Dobre o Parafilm sobre o cromossomo várias vezes até que fique dobrado em um tamanho compacto.
7. Armazene o cromossomo. O cromossomo dobrado pode ser armazenado a -20°C ou -80°C.

Observação: Certifique-se de usar luvas e proteção para os olhos ao trabalhar com brometo de etídio. O brometo de etídio é um mutagênico e cancerígeno.