Para construir uma árvore evolutiva:
Colete dados :Colete dados de sequência de DNA ou proteínas de um grupo diversificado de organismos, incluindo os organismos de interesse e alguns grupos externos para comparação.

Alinhamento de múltiplas sequências :Alinhe as sequências para criar um alinhamento de múltiplas sequências. Este alinhamento deve considerar a ordem e a similaridade dos nucleotídeos ou aminoácidos.

Selecione um método de construção de árvore: Escolha um método de construção de árvore filogenética, como Máxima Verossimilhança, Associação de Vizinhos ou inferência Bayesiana. Cada método usa diferentes algoritmos e abordagens estatísticas para calcular relações evolutivas.

Construa a árvore :Use o método selecionado para construir a árvore evolutiva. A saída geralmente será um diagrama ou cladograma representando os padrões de ramificação e as relações evolutivas entre os organismos estudados.

Análise de bootstrap (opcional) :execute a inicialização para avaliar o suporte estatístico para os padrões de ramificação na árvore. A análise de bootstrap reamostra repetidamente os dados para criar múltiplas árvores, fornecendo valores de confiança estatística (ou seja, valores de bootstrap) para cada ramificação.

Enraizar a árvore :Identifique e especifique a raiz da árvore. Normalmente é um nó ancestral ou grupo externo que representa o ancestral comum mais recente de todos os organismos da árvore.

Interprete a árvore :Analise os padrões e comprimentos de ramificação para inferir relações evolutivas, tempos de divergência e possíveis ancestrais comuns. Identificar clados (grupos de organismos que compartilham um ancestral comum) e a história evolutiva das espécies estudadas.

Refinar a árvore (opcional) :Se dados adicionais forem disponibilizados ou parâmetros diferentes forem usados, a árvore poderá ser refinada ou atualizada para melhorar sua precisão e resolução.