A teoria tradicional afirma que a vida complexa surgiu da competição e cooperação entre organismos.

No entanto, existem dois problemas importantes com esta teoria tradicional:

1- A evidência fóssil mostra que a vida complexa não se formou desta forma. Organismos aparecem repentinamente no registro fóssil – já complexos.


2- A competição darwiniana entre espécies não poderia ter sido o único motor da evolução da complexidade, uma vez que foi a competição dentro das espécies - bem como a cooperação das suas células - que facilitou a evolução da complexidade.


Uma teoria de dentro para fora da evolução da complexidade supera esses problemas.

A ideia de uma evolução "de dentro para fora" da complexidade biológica sugere que os próprios genomas podem sofrer uma evolução de complexidade.
Envolve competição e cooperação entre elementos genéticos egoístas dentro do genoma, e não entre espécies.

Por exemplo, transposons são sequências repetitivas de DNA que podem se mover dentro de um genoma. Os transposons podem proporcionar efeitos benéficos e prejudiciais ao genoma, contribuindo para a evolução.


Além disso, os genomas são sistemas complexos que se auto-organizam e criam novas mudanças genéticas e epigenéticas. Estas mudanças dão origem a novos fenótipos, que podem sofrer seleção natural ao nível do organismo. Este mecanismo de dentro para fora oferece uma explicação mais abrangente para as origens evolutivas de sistemas biológicos complexos.