Os cientistas têm a capacidade de sequenciar a molécula de DNA; em outras palavras, eles podem determinar a ordem das bases nucleotídicas em qualquer molécula dada. O sequenciamento da molécula de DNA pode ser o primeiro de uma série de etapas necessárias para descobrir como os nucleotídeos específicos de uma molécula de DNA interagem entre si e codificam para diferentes características em um organismo. O processo de sequenciamento do DNA está bastante envolvido, mas os sequenciadores automáticos de DNA estão minimizando o envolvimento humano necessário, pelo menos em parte do processo.
Preparo da Amostra
Para um sequenciador automático de DNA funcionar, deve detectar as quatro bases nucleotídicas que compõem o DNA: adenina, guanina, timina e citosina. Cientistas copiam um pedaço de DNA muitas vezes e usam enzimas de restrição para cortar o DNA em pedaços de tamanhos variados. Em seguida, eles adicionam uma pequena quantidade de base fluorescente marcada para cada lote de DNA. A base, que é adenina, timina, guanina ou citosina, se ligará ao seu complemento de base no final de um fio. Por exemplo, adenina se ligará a fios que terminam com timina, e guanina se ligará a fios que terminam com citosina.
Construção Automática de Sequenciadores de DNA
Um sequenciador automático de DNA é construído como um seqüenciador de DNA mais trabalho manual. Especificamente, um seqüenciador automático de DNA é um tanque de cerca de 1 pé de comprimento, com 96 poços de gel nos quais o DNA pode ser derramado. Em um seqüenciador automático de DNA, assim como em qualquer seqüenciador de DNA, o DNA é injetado nos poços de gel no topo do tanque, e uma carga negativa é aplicada a essa extremidade do tanque. A carga negativa fornece um forte ímpeto para que os filamentos de DNA percorram diferentes distâncias até o fim do tanque.
Injeção Automática
Um sequenciador automático de DNA injeta lotes de DNA, automaticamente, no topo do gel. Como tal, isso poupa aos pesquisadores uma quantidade enorme de tempo e esforço. Depois que os lotes são injetados, o seqüenciador aplica automaticamente uma carga negativa a uma extremidade do tanque, fazendo com que os fios migrem várias distâncias através do gel. As diferentes distâncias refletem os diferentes tamanhos de filamentos de DNA que passam pelo gel.
Detector
Muitas máquinas automáticas de sequenciamento de DNA são montadas para detectar o corante fluorescente nos filamentos de DNA que passam pelo gel. . Ao fazer isso, eles podem identificar os nucleotídeos que estão nas extremidades dos filamentos e registrá-los no computador. No entanto, os sequenciadores, na melhor das hipóteses, apresentam uma versão confusa de nucleotídeos de DNA. Depois de usar uma máquina automática de sequenciamento de DNA, você deve passar por um processo chamado "acabamento", no qual uma combinação de computadores e pesquisadores separa os resultados da detecção de DNA para reunir os dados em uma descrição abrangente de uma cadeia de DNA. Não surpreendentemente, esse processo pode demorar muito mais do que o processo real de seqüenciamento.
