*O método de sequenciamento Nanopore pode permitir um sequenciamento de DNA muito rápido*
*A equipe de pesquisa identifica um novo fenômeno que leva a uma melhor compreensão do método*
O sequenciamento de DNA é uma parte fundamental da biologia moderna e é usado em muitos contextos, como diagnóstico médico, ciência forense e biologia evolutiva. Muitas novas técnicas surgiram recentemente para sequenciamento de DNA, oferecendo muitas vantagens sobre o sequenciamento Sanger anteriormente dominante. Estas novas técnicas empregam métodos mais rápidos e baratos, muitas vezes permitindo o sequenciamento de fragmentos de DNA em questão de horas. O sequenciamento de nanoporos usa nanoporos biológicos ou sintéticos para forçar moléculas únicas de DNA ou RNA através de um poro de proteína. Este processo pode então ser usado para estabelecer a sequência de nucleotídeos ao longo de uma fita de DNA ou RNA.
Jörg Bewarder, ambos pós-doutorados no Departamento de Física, e o professor Ulrich Rant, chefe do departamento, identificou um novo fenômeno que influencia a detecção de nanoporos e, portanto, melhorará a compreensão e aplicação desta tecnologia.
Atualmente, a detecção de nanoporos em poros biológicos depende da desaceleração controlada da translocação de moléculas de DNA através da aplicação de um campo elétrico sobre o nanoporo. Os pesquisadores mostram, por meio de simulações de dinâmica molecular em multiescala, que, na presença deste campo, partes do DNA podem sair transitoriamente do poro e entrar no solvente, o que afeta o sinal medido do DNA e pode levar a dificuldades na interpretação dos dados.
Getfert e Rant:"A detecção de nanoporos é uma tecnologia altamente promissora e nosso trabalho contribui para a compreensão fundamental do processo de detecção de nanoporos, permitindo que os cientistas desenvolvam e otimizem ainda mais o método."
O estudo do departamento de física foi publicado recentemente na renomada revista científica Nature Communications.