Sim, a posição sistemática do _Archaeopteryx_ tem sido desafiada nos últimos anos. Tradicionalmente, o _Archaeopteryx_ tem sido considerado um fóssil de transição entre dinossauros e aves, com base na sua combinação de características de dinossauros e aves. No entanto, alguns estudos recentes sugeriram que o _Archaeopteryx_ pode não ser um ancestral direto das aves modernas e, em vez disso, pode ser um parente próximo dos dinossauros _Deinonychus_ e _Velociraptor_.
Um dos principais argumentos contra a visão tradicional do Archaeopteryx como ancestral direto das aves é o fato de que faltam algumas das principais características características das aves modernas. Por exemplo, _Archaeopteryx_ tem uma cauda longa e óssea, enquanto as aves modernas têm caudas curtas e pigóstilas. _Archaeopteryx_ também tem três dedos em cada asa, enquanto os pássaros modernos têm apenas dois.
Outro argumento contra a visão tradicional do _Archaeopteryx_ é o fato de ele ter sido encontrado na mesma formação geológica que o _Compsognathus_, um pequeno dinossauro carnívoro que não está intimamente relacionado com as aves. Isto sugere que o _Archaeopteryx_ pode ter vivido ao lado dos dinossauros, em vez de ser um ancestral direto dos pássaros.
Apesar destes desafios, a posição sistemática do _Archaeopteryx_ continua a ser uma questão de debate. Alguns cientistas ainda acreditam que o _Archaeopteryx_ é um fóssil de transição entre dinossauros e pássaros, enquanto outros acreditam que é um parente próximo dos dinossauros _Deinonychus_ e _Velociraptor_. Mais pesquisas são necessárias para resolver esse debate.