Esta é uma pergunta complicada! Aqui está o porquê:
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depende da temperatura: A quantidade de energia térmica em um objeto é diretamente proporcional à sua temperatura. Um balão maior * na mesma temperatura * que um balão menor terá mais energia térmica porque possui mais moléculas.
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Mas, também depende do material: Se os balões forem feitos de diferentes materiais, sua condutividade térmica e capacidade de calor afetarão a quantidade de energia que eles possuem. Um balão maior feito de um material que absorve mais calor (como uma borracha grossa) provavelmente terá mais energia térmica do que um balão menor feito de um material mais fino.
em suma: Não há uma resposta simples sem saber a temperatura dos balões e os materiais dos quais são feitos.