Existem várias críticas e desafios importantes ao conceito de design inteligente:

Falta de evidências:
Os proponentes do design inteligente argumentam frequentemente que a complexidade de certos sistemas biológicos ou do universo como um todo aponta para a existência de um designer inteligente. No entanto, eles não fornecem provas empíricas ou hipóteses testáveis ​​para apoiar as suas afirmações. O design inteligente depende de argumentos e inferências filosóficas, e não de evidências científicas.

Ausência de explicação naturalística:
O design inteligente não oferece uma explicação naturalista para a diversidade e complexidade biológica observada. Sugere que certas características ou estruturas são o resultado de uma intervenção inteligente, e não de processos naturais, como a evolução através da seleção natural. Esta abordagem contradiz os princípios fundamentais da ciência, que exigem explicações baseadas em causas naturais.

Infalseabilidade:
O design inteligente é criticado por ser infalsificável, o que significa que não pode ser testado empiricamente ou refutado através de experimentação científica. O conceito de designer inteligente não está sujeito a investigação científica e não gera previsões que possam ser testadas e verificadas através de observação e experimentação.

Definição vaga de designer:
Os proponentes do design inteligente referem-se frequentemente a um designer inteligente sem definir ou descrever claramente a natureza, características ou atributos deste designer. A falta de uma definição clara torna difícil o envolvimento em discussões científicas significativas e a avaliação da validade dos seus argumentos.

Separação entre Ciência e Religião:
Os críticos argumentam que o design inteligente confunde a linha entre ciência e religião. Tenta introduzir crenças religiosas e explicações teológicas no discurso científico, o que é inconsistente com os princípios da investigação naturalista e com a abordagem metodológica da ciência.

Explicações alternativas:
A investigação científica e os avanços na biologia evolutiva, genética e outros campos fornecem explicações alternativas para a complexidade e diversidade das formas de vida. Estas explicações baseiam-se em evidências empíricas e seguem os princípios da seleção natural, da variação aleatória e da descendência comum.

É importante notar que estas críticas não refutam diretamente o conceito de design inteligente. No entanto, destacam as deficiências do design inteligente como teoria científica e a sua incompatibilidade com os fundamentos metodológicos e a abordagem empírica da ciência moderna.