Um livre, O kit de ferramentas de código aberto para ajudar os pesquisadores a lidar com a sobrecarga de gerenciamento de dados foi desenvolvido pela equipe de informática do John Innes Center.

O kit de ferramentas, chamado "dtool, "é um pacote de software para gerenciar dados científicos e torná-los acessíveis para pesquisadores da linha de frente que trabalham em várias áreas de projetos.

Ele funciona empacotando dados e metadados - informações que identificam os dados - em caixas ou conjuntos de dados úteis.

Esses pacotes independentes de dados e metadados facilitam a movimentação de conjuntos de dados e a criação de cópias de backup remotas.

As ferramentas funcionam com sistemas de arquivos tradicionais e também com opções de nuvem, como Amazon S3 e Microsoft Azure, permitindo que os pesquisadores escolham a solução de armazenamento que melhor se adapta às suas necessidades e orçamentos.

O sistema significa que os pesquisadores podem encontrar rapidamente conjuntos de dados de interesse sem a dor de cabeça de ter que acessar e manter um banco de dados central. Os metadados empacotados podem ser usados ​​para verificar a integridade dos dados na caixa.

A equipe do John Innes Center descreve os benefícios do dtool em um artigo publicado no PeerJ - Journal of Life and Environmental Sciences.

Eles dizem que o kit de ferramentas oferece paz de espírito porque os pesquisadores sabem que os dados que sustentam os resultados científicos são seguros, pesquisável e acessível em um ambiente de pesquisa altamente distribuído, como o John Innes Center.

Dr. Tjelvar Olsson, Gerente sênior de dados científicos e infraestrutura no John Innes Center, quem é um dos criadores do sistema, disse:"No John Innes Center, temos 40 grupos de pesquisa diferentes lidando com grandes volumes de todos os tipos de dados.

"Queremos que mais pessoas usem o dtool para gerenciar seus dados. Nós o projetamos de forma que se encaixe em sua maneira de trabalhar, um leve, solução usada de uma forma mínima que se adapta ao que eles já estão fazendo. "

Um dos primeiros a adotar o dtool é a equipe da Dra. Brande Wulff, que trabalha com resistência a doenças em trigo no John Innes Center.

Avanços em tecnologias como sequenciamento genético e biologia de sistemas computacionais contribuíram para uma explosão nos volumes e tipos de dados. Embora isso tenha levado a grandes avanços na ciência vegetal e microbiana, trouxe desafios substanciais no gerenciamento e processamento de dados para os pesquisadores da linha de frente.

Dr. Matthew Hartley, Chefe da equipe de informática do JIC, que ajudou a conceber dtool, disse que o impacto já estava sendo sentido.

"Gerenciar dados em escala é um dos maiores desafios da pesquisa biológica computacional. O dtool tornou o armazenamento de nossos dados mais barato, nos deu tranquilidade e acelerou nossas pesquisas. ".

"Gerenciamento de dados leves com dtool" é publicado em PeerJ .