A estabilidade de uma alfa-hélice se deve principalmente aos seguintes fatores:

1. Ligação de hidrogênio: O fator mais importante é a formação de ligações de hidrogênio entre os grupos de amida na espinha dorsal (N-H) e carbonil (C =O) de aminoácidos espaçados quatro resíduos separados ao longo da hélice. Essas ligações de hidrogênio criam uma rede forte que mantém a hélice unida.

2. Interações van der Waals: A embalagem fechada das cadeias laterais de aminoácidos dentro da hélice contribui para a estabilidade através das interações van der Waals. Essa interação surge das flutuações temporárias das nuvens de elétrons em torno dos átomos, levando a uma atração fraca, mas aditiva, entre os grupos não polares.

3. Interações eletrostáticas: As interações eletrostáticas entre as cadeias laterais carregadas podem influenciar a estabilidade da hélice. Por exemplo, as interações entre resíduos carregados positivamente e resíduos carregados negativamente podem estabilizar a hélice.

4. Efeito hidrofóbico: As cadeias laterais não polares tendem a se agrupar no interior da hélice, longe das moléculas de água circundantes. Esse efeito hidrofóbico contribui para a estabilidade geral da hélice.

5. PROLINE e GLICINA DISCURSÃO: A prolina, com sua estrutura cíclica, interrompe o padrão regular de ligação de hidrogênio na hélice. A glicina, com seu tamanho pequeno, também pode atrapalhar a hélice devido à sua flexibilidade.

fatores que afetam a estabilidade:

* sequência de aminoácidos: A sequência de aminoácidos em uma proteína afeta significativamente a formação e a estabilidade da hélice. Certos aminoácidos são mais propensos à formação de hélice do que outros.
* Condições do solvente: A presença de certos solventes ou íons pode interromper a ligação de hidrogênio e influenciar a estabilidade da hélice.
* Temperatura: O aumento da temperatura pode interromper as ligações de hidrogênio e outras interações, levando ao desdobramento da hélice.

No geral, a estabilidade de uma alfa-hélice é uma interação complexa de vários fatores. Enquanto a ligação de hidrogênio desempenha um papel crucial, outras interações como as forças de van der Waals, interações eletrostáticas e o efeito hidrofóbico contribuem significativamente. A sequência de aminoácidos específica e as condições ambientais também influenciam a estabilidade da alfa-hélice.