Na verdade, existem mais de quatro mecanismos que recebem substratos no estado de transição, mas aqui estão quatro principais:
1. Proximidade e orientação: As enzimas reúnem reagentes na orientação correta para facilitar a reação. Isso reduz a entropia do sistema, tornando a reação mais favorável.
2. Tensão ou distorção: As enzimas podem vincular substratos de uma maneira que distorça sua forma, tornando -as mais reativas. Isso geralmente é alcançado por substratos de ligação em uma conformação próxima ao estado de transição.
3. Interações eletrostáticas: As enzimas podem usar aminoácidos ou cofatores carregados para estabilizar o estado de transição e diminuir sua energia. Isso é particularmente importante para reações que envolvem intermediários carregados.
4. Catálise de base ácida: As enzimas podem usar resíduos de aminoácidos para doar ou aceitar prótons, facilitando a formação do estado de transição. Isso é crucial para as reações que envolvem a transferência de prótons.
Outros mecanismos importantes: * Catálise de íons metálicos: Algumas enzimas usam íons metálicos para estabilizar intermediários carregados ou para facilitar as reações redox.
* Catálise covalente: As enzimas podem formar ligações covalentes temporárias com substratos para alterar sua reatividade.
É importante lembrar que esses mecanismos geralmente trabalham juntos em uma interação complexa para alcançar o efeito catalítico desejado. O mecanismo específico dependerá da enzima e reação individuais que estão sendo catalisadas.