A ligação intermolecular do metanol é a ligação de hidrogênio. A ligação de hidrogênio é uma interação dipolo-dipolo que ocorre entre um átomo de hidrogênio ligado a um átomo altamente eletronegativo (como oxigênio, nitrogênio ou flúor) e outro átomo eletronegativo. No caso do metanol, o átomo de hidrogênio do grupo hidroxila está ligado ao átomo de oxigênio altamente eletronegativo, o que cria uma carga parcial positiva no átomo de hidrogênio. Esta carga parcial positiva pode então interagir com a carga parcial negativa de outro átomo de oxigênio em uma molécula de metanol próxima, formando uma ligação de hidrogênio.