A ligação de hidrogênio não é um tipo de ligação iônica. Em vez disso, é uma interação dipolo-dipolo entre um átomo de hidrogênio que está ligado covalentemente a um átomo eletronegativo (como N, O ou F) e outro átomo eletronegativo. O átomo eletronegativo atrai os elétrons na ligação covalente, criando uma carga parcial positiva no átomo de hidrogênio. Essa carga parcial positiva interage então com a carga parcial negativa do outro átomo eletronegativo, formando uma ligação de hidrogênio.

Ao contrário das ligações iônicas, que são formadas pela transferência de elétrons de um átomo para outro, as ligações de hidrogênio são formadas pela atração eletrostática entre cargas parciais. As ligações de hidrogênio são mais fracas que as ligações iônicas, mas ainda desempenham um papel importante na estrutura e função de moléculas e materiais. Por exemplo, as ligações de hidrogênio são responsáveis ​​pelo alto ponto de ebulição da água, pela estrutura das proteínas e pelo emparelhamento de bases do DNA.