As proteínas movem-se constantemente e mudam sua conformação. A dinâmica molecular normalmente responde à questão de quais são as possíveis conformações das proteínas. Proteínas, Contudo, têm uma estrutura altamente complicada e lotada, e entender as mudanças em seu comportamento é uma tarefa desafiadora devido ao grande número de coordenadas a serem monitoradas. Digerir a grande quantidade de dados moleculares muitas vezes envolve a visualização 3D criativa, mas mesmo com um esforço considerável, detalhes importantes podem ser perdidos. Isso levou a um problema duplo; não foi apenas a visualização de dados um desafio, mas os cientistas também correram o risco de ignorar aspectos de seus próprios resultados. Uma nova ferramenta chamada CONAN (ANALISE DE CONtact), desenvolvido a partir da "Biomecânica Molecular" da HITS, pode aliviar esses problemas compactando esses dados 3-D em imagens 2-D mais simples, capturando as principais interações, mapas de contato nomeados.

Mapas de contato medem distâncias entre resíduos, comprimindo estruturas 3-D em imagens 2-D. Isso geralmente facilita a interpretação dos dados e torna as alterações importantes mais fáceis de detectar. Esses mapas de contato geralmente só foram usados ​​para estudar estruturas de proteínas únicas como um único instantâneo, mas na verdade eles podem ser facilmente obtidos para muitas estruturas, resultando em um filme de mapa de contato. Esta análise de alguma forma estende o ditado "uma figura vale mais do que 1000 palavras" para o regime dinâmico, uma vez que cria uma infinidade de instantâneos de mapas de contato possíveis a partir de uma simulação, identificar subpopulações conformacionais e transições.

Até agora, métodos de análise baseados em mapas de contato têm sido amplamente usados ​​apenas para compreender estruturas únicas, tais como aqueles na base de dados de proteínas (PDB). Mesmo quando os métodos foram generalizados para simulações dinâmicas, as implementações costumavam ser vários scripts de análise "ad hoc", já que não havia uma ferramenta padronizada. Isso significava que as quantidades medidas e as definições eram inconsistentes e os resultados não eram diretamente comparáveis. A nova ferramenta "CONAN" porém é uma ferramenta padronizada, pacote fácil de usar que permite vários tipos diferentes de análises, por exemplo, incluindo análise de componentes principais e análise de cluster.

A ferramenta desenvolvida pelos pesquisadores do HITS Csaba Daday e Frauke Gräter do grupo de Biomecânica Molecular, bem como o ex-membro do grupo Davide Mercadante, preenche uma lacuna e oferece uma abordagem abrangente programa amigável que não requer experiência em programação que pode ajudar os cientistas a realizar cálculos de dinâmica molecular a compreender e apresentar seus dados. Esperançosamente, isso levará a um uso mais difundido dessas medidas, e um conjunto mais uniforme de definições. A ferramenta é de acesso aberto e gratuita. A equipe da HITS também otimiza constantemente o software e está aberta a comentários da comunidade.