p Uma nova e poderosa maneira de analisar como os medicamentos interagem com as moléculas do corpo pode ajudar na concepção de melhores tratamentos com menos efeitos colaterais. p A maioria dos produtos farmacêuticos funcionam ligando-se a um pequeno local nas grandes proteínas que visam, fazendo com que a proteína mude de forma e, portanto, também sua atividade.

p Para encontrar drogas que agem especificamente contra uma proteína sem também se ligar a outras semelhantes - e, portanto, causar efeitos colaterais - é importante entender esse local de ligação em detalhes. Muitas técnicas atuais podem fornecer apenas informações parciais, dando detalhes sobre quais partes da droga em si são importantes e, em alguns casos, a estrutura geral da proteína.

p Pesquisadores da Universidade de East Anglia desenvolveram agora uma nova abordagem que pode revelar o outro lado do quebra-cabeça - quais partes da proteína interagem com a droga. Ele adapta uma técnica conhecida como espectroscopia de ressonância magnética nuclear (NMR) baseada em ligante para revelar quais aminoácidos na proteína estão envolvidos na ligação à droga.

p Eles conseguiram fazer isso examinando a droga e sem a necessidade de rotular a proteína, como é exigido em alguns outros métodos.

p "Projetar novos medicamentos é um pouco como encontrar a peça adequada que se encaixa em um quebra-cabeça, "disse o Dr. Jesus Angulo, palestrante sênior da Escola de Farmácia da UEA, quem liderou a pesquisa. "Não é apenas a forma, mas também o conteúdo gráfico da peça que deve corresponder à imagem ao redor.

p "Nossa nova abordagem nos permite agora encontrar a peça exata que corresponde à forma complementar e ao conteúdo gráfico em um local de ligação de proteína."

p A nova técnica de NMR, que é chamado DEEP-STD NMR, é descrito no jornal Angewandte Chemie .

p É baseado em uma técnica existente de NMR usada para estudar as interações droga-proteína chamada STD-NMR. Isso funciona estimulando todos os aminoácidos de uma proteína, irradiando-os.

p É então possível descobrir onde esse estado de excitação é transferido para locais químicos na droga quando se liga a ela. Essa abordagem é semelhante a cobrir a proteína com tinta e, em seguida, pressionar o medicamento contra ela para ver quais partes ficam manchadas.

p Mas o Dr. Angulo e seus colegas, cujo trabalho foi financiado pelo BBSRC, descobriram que é possível irradiar a proteína com frequências diferentes para excitar diferentes tipos de aminoácidos.

p Isso permitiu que eles descobrissem quais aminoácidos no local de ligação da proteína estão diretamente em contato com a droga a partir das "marcas de tinta" que deixam para trás.

p Isso significa que eles só precisam olhar para a droga para descobrir as partes importantes da proteína que estão sendo visadas. Eles foram capazes de obter mais informações sobre os aminoácidos envolvidos usando uma combinação de óxido de deutério, ou água pesada, e água normal como solvente.

p O time, que incluiu pesquisadores do Instituto Quadram em Norwich, demonstraram seu método em duas proteínas bem estudadas - uma enzima chamada trans-sialidase intramolecular, que é produzida por uma bactéria encontrada no intestino humano, e uma subunidade da Toxina do Cólera.

p Dr. Angulo disse:"Nosso novo método oferece aos pesquisadores uma ferramenta poderosa para compreender indiretamente a arquitetura da bolsa de ligação de proteínas.

p "Isso permitirá que eles determinem quais são os melhores requisitos químicos para um medicamento interagir especificamente com um determinado receptor de proteína. Isso pode levar a candidatos a medicamentos mais fortes e seletivos, enquanto quantidades menores seriam necessárias para desencadear o efeito desejado. "