Tipos de polimerases de RNA e seus promotores
As polimerases de RNA são enzimas responsáveis pela transcrição do DNA para o RNA. Diferentes tipos de polimerases de RNA existem em eucariotos e procariontes, cada um com suas funções específicas e sequências de reconhecimento de promotores.
Prokaryotes:
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RNA polimerase (RNAP) :A RNA polimerase única em procariotos transcreve todos os tipos de RNA (mRNA, tRNA, rRNA).
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Estrutura do promotor: *
-10 elemento (caixa de pribnow): Sequência Tataat localizada cerca de 10 pares de bases a montante do local de partida da transcrição.
* elemento -35: A sequência ttgaca localizou cerca de 35 pares de bases a montante do local de partida da transcrição.
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elementos a montante: Alguns promotores têm elementos adicionais mais a montante, influenciando a eficiência da transcrição.
Eucariotes:
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RNA Polimerase I (Pol i): Responsável pela transcrição de genes de RNA ribossômico (rRNA).
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Estrutura do promotor: *
Promotor do núcleo: Uma região que contém um elemento central e um elemento de controle a montante (UCE).
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elemento central: Uma sequência curta localizada a cerca de 40 pb a montante do local de início da transcrição.
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uce: Uma região localizada aproximadamente 100 pb a montante do local inicial da transcrição, geralmente contendo uma sequência conservada chamada "elemento a montante" (UE).
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RNA Polimerase II (Pol II): Transcreve genes codificadores de proteínas (mRNA) e alguns pequenos genes de RNA nuclear (snRNA).
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Estrutura do promotor: *
Promotor do núcleo: Normalmente contém os seguintes elementos:
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caixa de tata: Uma sequência conservada localizada a cerca de 25 a 30 pb a montante do local de partida da transcrição.
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Iniciador (INR): Uma sequência localizada em torno do local inicial da transcrição.
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elemento promotor a jusante (DPE): Localizado a jusante do local de início da transcrição.
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bre (elemento de reconhecimento tfiib): Uma sequência localizada a montante da caixa TATA, reconhecida pelo fator de transcrição IIB (TFIIB).
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elementos regulatórios a montante: Esses elementos podem ser localizados centenas ou até milhares de pares de bases a montante do promotor principal e influenciar a taxa de transcrição. Exemplos incluem:
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caixa de caat: Uma sequência de consenso que liga os fatores de transcrição.
* Caixa GC: Uma sequência rica em GC reconhecida por fatores de transcrição.
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intensificadores: Sequências de DNA que podem estimular a transcrição, geralmente localizadas longe do promotor principal.
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RNA Polimerase III (Pol III): Transcrição RNA de transferência (tRNA), RNA ribossômico 5S (5S rRNA) e alguns pequenos genes de RNA nuclear (snRNA).
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Estrutura do promotor: *
Promotor interno: Localizado dentro da região transcrita para genes tRNA e 5S rRNA.
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Promotor Upstream: Localizado a montante da região transcrita para alguns genes snRNA.
Tabela de resumo:
| RNA polimerase | Transcrições | Promotores |
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| Rnap procariótico | mRNA, tRNA, rRNA | -10 elemento, -35 elemento, elementos a montante |
| Poli eucariótico | rRNA | Promotor Core, UCE |
| Eucariótico Pol II | mRNA, algum snRNA | Promotor Core (Tata Box, INR, DPE, BRE), elementos regulatórios a montante |
| Eucariótico Pol III | tRNA, 5S rRNA, algum snRNA | Promotor interno (para tRNA, 5s rRNA), promotor a montante (para algum snRNA) |
Esta tabela não é exaustiva, pois existem diferentes tipos de promotores e seus elementos regulatórios em cada grupo. As seqüências e estruturas específicas dos promotores podem variar, influenciando a eficiência e a regulação da transcrição.
